http://wiki.neurotycho.org/api.php?action=feedcontributions&user=Oosugi&feedformat=atomNeuroTychoWiki - User contributions [en]2024-03-28T12:27:35ZUser contributionsMediaWiki 1.31.0http://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins&diff=651Begins2012-01-25T06:33:14Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div>[[File:Begins.png]]<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/<br />
<br />
[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
*; Data<br />
# "Day 1" is a dataset already uploaded on Neurotycho (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day 2" is a dataset recorded on the next day of "Day1".<br />
# "Sleep" condition is a dataset in "Sleep task" recorded on separate day. <br />
:Additional data will be uploaded soon.<br />
<br />
*;Analysis<br />
**; Time window<br />
:There are three time windows (size=500ms) prepared for each of two task events, "Show food" and "Food place".<br />
# "Show food" + "Early": window was set between -400 ms and -1 ms around "Show food" event.<br />
# "Show food" + "Middle": window was set between 0 ms and +399 ms around "Show food" event.<br />
# "Show food" + "Late": window was set between +400 ms and +799 ms around "Show food" event.<br />
# "Food place" + "Early": window was set between -400 ms and -1 ms around "Food place" event.<br />
# "Food place" + "Middle": window was set between 0 ms and +399 ms around "Food place" event. At some point during the window, monkey had already started reaching motion.<br />
# "Food place" + "Late": window was set between +400 ms and + 799 ms around "Food place" event.<br />
<br />
:*; Frequency band power<br />
:Power spectrum of ECoG data at each time window was calculated by FFT.<br />
# "Delta": power spectrum at 2 Hz.<br />
# "Theta": power spectrum summated within 4 Hz and 6 Hz.<br />
# "Alpha": power spectrum summated within 8 Hz and 12 Hz. <br />
# "Beta": power spectrum summated within 14 Hz and 28 Hz.<br />
# "Low Gamma": power spectrum summated within 30 Hz and 58 Hz except 50 Hz.<br />
# "High Gamma": power spectrum summated within 60 Hz and 100 Hz.<br />
<br />
:*; Statistics test<br />
:MannWhitney test will be used for statistical comparison. Circles indicate locations of electrode.<br />
:After setting all parameters and when "Draw" button is pressed, statistical comparison will be made. Results will be shown by color by following rules.<br />
# Red: condition 1 > condition 2 (p < 0.0001).<br />
# Brown: condition 1 > condition 2 (p < 0.001).<br />
# Light blue: condition 2 > condition 1 (p < 0.001).<br />
# Blue: condition 2 > condition 1 (p < 0.0001). <br />
<br />
*; Guide (in Japanese)<br />
:Please download BEGINS Guidebook from a link below.<br />
:http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf<br />
:English guidebook will be released soon.<br />
<br />
CONTRIBUTORS<br />
** Original Application Design, Data Preparation: Naoya Oosugi <br />
** Web application: T M<br />
** Data Collection: Toru Yanagawa<br />
** General Direction: Naotaka Fujii<br />
<br />
(2011/11/10) We changed time window.</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins_jp&diff=650Begins jp2012-01-25T06:31:56Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div>[[File:begins_jp.png]]<br />
*; 日本語のBEGINSへのリンク<br />
http://begins.neurotycho.org/begins.html<br />
*; NeurotychoBEGINSとは<br />
:最先端の脳の実際のデータを誰でも簡単に解析し、脳科学でいうところの「機能局在性」や「半球差」などを見てとる事ができるアプリケーションです。(ECoGという方法でニホンザルから計測しました。)<br />
:詳細は藤井直敬激筆の指南書にて(ページ下部からDL可能)<br />
:大幅アップデートを行いました.脱β!(2011/09/21)<br />
:以前のバージョンはここ([[http://wiki.neurotycho.org/Begins_jp_OLD]])です。<br />
<br />
<br />
<br />
[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
[[File:Rank.png]]<br />
計測されているサルはBです.<br />
<br />
*;基本的な使い方<br />
#ラジオボタンの左側で条件1、右側で条件2を設定し、「描画」ボタンをクリックすることでその条件のデータを読み込み、条件間の違いを解析します。<br />
#解析の結果は左の脳の絵に図示されます。赤い点はその場所で条件1のほうが反応が有意に大きかったとき、青い点は条件2で反応が有意に大きかったとき、灰色の点は有意な差がみられなかた場所を示します。<br />
#どの条件のときにどの場所の反応が大きくなるかを色々な条件で試してみましょう。解析の絵は下のパネルを選択し「パネルへコピー」ボタンを押すと結果の絵が保存されるので色々な絵を見比べてみましょう。<br />
<br />
<br />
*; データについて<br />
# ”Day1” のデータは下記のURLにて公開してあります.詳細はそこを参照してください. (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day2" のデータは"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.<br />
# "Day3" のデータも"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.用いたサルはペアのサルも含めて同じです.<br />
# "Sleep" 条件は別の日に行った麻酔実験の麻酔時のデータを用いてます. <br />
:この麻酔実験のデータと詳細は近々アップロードします.<br />
<br />
*;解析について<br />
**;誰が<br />
:自分(ECoGを測定されているサル)と相手のどちらがエサを食べたか条件なのかを指定します.”どちらか”というのは誰が食べたのかを区別しないという意です.<br />
:*;どの手で<br />
:エサを食べたのを右と左のどちらで行った条件かを指定します."誰が"を相手にした場合は相手がどちらの手でエサを食べたのかを指定することになります.”どちらか”というのはどの手で食べたのかを区別しないという意です<br />
:*;ペアのサル<br />
:競合相手のサルは2通りいて,Aのサルは上位のサルでCのサルは下位のサルです.詳しい条件は下記のURLの指南書を参考にしてください.<br />
:*;衝突<br />
:"あり"とした場合,両サルが手の届く範囲にエサを置いた条件を指定することになります(上の図の下の条件)."なし"とした場合は片方のサルにだけ届く位置にエサが置かれました."どちらも"とした場合,エサの置かれた位置を区別しないという意です.<br />
<br />
:*; 時間窓<br />
:条件”エサ見せ”と”エサ置き”を基準とした時間でデータを解析します.時間はすべて500msの幅をもたせています.<br />
# "エサ見せ" と "前": エサ見せ開始時刻の前400msから前1msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "前後": エサ見せ開始時刻の前後0msから後399msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "後": エサ見せ開始時刻の後400msから後799msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前": エサ見せ終了時刻の前400msから前1msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前後": エサ見せ終了時刻の前後0msから後399msまでの時間で解析をします.サルの腕の運動が始まる時間帯です.<br />
# "エサ置き" と "後": エサ見せ終了時刻の後400msから後799msまでの時間で解析をします.<br />
<br />
:*;信号 (周波数成分,バンドパワー)について<br />
:脳波を構成する成分を選択します.時間窓にFFTでパワースペクトルを求めています.<br />
# "デルタ": 2.5 Hzのパワースペクトル.<br />
# "シータ": 5 Hz から7.5 Hzのパワースペクトルの和<br />
# "アルファ": 10 Hz から 12.5 Hzのパワースペクトルの和. <br />
# "ベータ": 15 Hz から 30 Hzのパワースペクトルの和.<br />
# "低ガンマ": 32.5 Hz から 60 Hzのパワースペクトルの和.ただし電源ノイズがのる 50 Hzを除く.<br />
# "高ガンマ": 62.5 Hz から100 Hzのパワースペクトルの和..<br />
<br />
:*; 統計検定<br />
:MannWhitney テストをチャンネル毎に行います. 円の位置は電極の位置を示します.<br />
:条件を設定後,「描画」ボタンを押すと条件間で検定をかけ,以下の有意水準で有意差があったとみなせるチャンネルを色づけされます.<br />
# 赤色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.01).<br />
# 橙色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.05).<br />
# 水色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.05).<br />
# 青色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.01). <br />
<br />
*; 指南書<br />
:下記のURLからダウンロードできます.<br />
:http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf<br />
<br />
<br />
*;スタッフ<br />
** 企画,解析: Naoya Oosugi <br />
** Web アプリ開発: T M<br />
** 実験者: Toru Yanagawa<br />
** 総監督: Naotaka Fujii<br />
<br />
*;変更点<br />
: 時間窓を変更しました.<br />
: データを3日分に増やしました.<br />
: 有意水準を甘くしました.(2011/09/29)<br />
: 時間窓を変更しました.以前のデータは/old2/の下にあります. (2012/01/25)</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins_jp&diff=457Begins jp2011-09-30T02:30:42Z<p>Oosugi: </p>
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<div>[[File:begins_jp.png]]<br />
*; 日本語のBEGINSへのリンク<br />
http://begins.neurotycho.org/begins.html<br />
*; NeurotychoBEGINSとは<br />
:最先端の脳の実際のデータを誰でも簡単に解析し、脳科学でいうところの「機能局在性」や「半球差」などを見てとる事ができるアプリケーションです。(ECoGという方法でニホンザルから計測しました。)<br />
:詳細は藤井直敬激筆の指南書にて(ページ下部からDL可能)<br />
:大幅アップデートを行いました.脱β!(2011/09/21)<br />
:以前のバージョンはここ([[http://wiki.neurotycho.org/Begins_jp_OLD]])です。<br />
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[[File:Neurotycho.png]]<br />
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[[File:Rank.png]]<br />
計測されているサルはBです.<br />
<br />
*;基本的な使い方<br />
#ラジオボタンの左側で条件1、右側で条件2を設定し、「描画」ボタンをクリックすることでその条件のデータを読み込み、条件間の違いを解析します。<br />
#解析の結果は左の脳の絵に図示されます。赤い点はその場所で条件1のほうが反応が有意に大きかったとき、青い点は条件2で反応が有意に大きかったとき、灰色の点は有意な差がみられなかた場所を示します。<br />
#どの条件のときにどの場所の反応が大きくなるかを色々な条件で試してみましょう。解析の絵は下のパネルを選択し「パネルへコピー」ボタンを押すと結果の絵が保存されるので色々な絵を見比べてみましょう。<br />
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<br />
*; データについて<br />
# ”Day1” のデータは下記のURLにて公開してあります.詳細はそこを参照してください. (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day2" のデータは"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.<br />
# "Day3" のデータも"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.用いたサルはペアのサルも含めて同じです.<br />
# "Sleep" 条件は別の日に行った麻酔実験の麻酔時のデータを用いてます. <br />
:この麻酔実験のデータと詳細は近々アップロードします.<br />
<br />
*;解析について<br />
**;誰が<br />
:自分(ECoGを測定されているサル)と相手のどちらがエサを食べたか条件なのかを指定します.”どちらか”というのは誰が食べたのかを区別しないという意です.<br />
:*;どの手で<br />
:エサを食べたのを右と左のどちらで行った条件かを指定します."誰が"を相手にした場合は相手がどちらの手でエサを食べたのかを指定することになります.”どちらか”というのはどの手で食べたのかを区別しないという意です<br />
:*;ペアのサル<br />
:競合相手のサルは2通りいて,Aのサルは上位のサルでCのサルは下位のサルです.詳しい条件は下記のURLの指南書を参考にしてください.<br />
:*;衝突<br />
:"あり"とした場合,両サルが手の届く範囲にエサを置いた条件を指定することになります(上の図の下の条件)."なし"とした場合は片方のサルにだけ届く位置にエサが置かれました."どちらも"とした場合,エサの置かれた位置を区別しないという意です.<br />
<br />
:*; 時間窓<br />
:条件”エサ見せ”と”エサ置き”を基準とした時間でデータを解析します.時間はすべて500msの幅をもたせています.<br />
# "エサ見せ" と "前": エサ見せ開始時刻の前800msから前401msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "前後": エサ見せ開始時刻の前400msから前1msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "後": エサ見せ開始時刻の前後0msから後399msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前": エサ見せ終了時刻の前200msから後199msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前後": エサ見せ終了時刻の後200msから後599msまでの時間で解析をします.サルの腕の運動が始まる時間帯です.<br />
# "エサ置き" と "後": エサ見せ終了時刻の後600msから後999msまでの時間で解析をします.<br />
<br />
:*;信号 (周波数成分,バンドパワー)について<br />
:脳波を構成する成分を選択します.時間窓にFFTでパワースペクトルを求めています.<br />
# "デルタ": 2.5 Hzのパワースペクトル.<br />
# "シータ": 5 Hz から7.5 Hzのパワースペクトルの和<br />
# "アルファ": 10 Hz から 12.5 Hzのパワースペクトルの和. <br />
# "ベータ": 15 Hz から 30 Hzのパワースペクトルの和.<br />
# "低ガンマ": 32.5 Hz から 60 Hzのパワースペクトルの和.ただし電源ノイズがのる 50 Hzを除く.<br />
# "高ガンマ": 62.5 Hz から100 Hzのパワースペクトルの和..<br />
<br />
:*; 統計検定<br />
:MannWhitney テストをチャンネル毎に行います. 円の位置は電極の位置を示します.<br />
:条件を設定後,「描画」ボタンを押すと条件間で検定をかけ,以下の有意水準で有意差があったとみなせるチャンネルを色づけされます.<br />
# 赤色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.01).<br />
# 橙色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.05).<br />
# 水色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.05).<br />
# 青色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.01). <br />
<br />
*; 指南書<br />
:下記のURLからダウンロードできます.<br />
:http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf<br />
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<br />
*;スタッフ<br />
** 企画,解析: Naoya Oosugi <br />
** Web アプリ開発: T M<br />
** 実験者: Toru Yanagawa<br />
** 総監督: Naotaka Fujii<br />
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*;変更点<br />
: 時間窓を変更しました.<br />
: データを3日分に増やしました.<br />
: 有意水準を甘くしました.(2011/09/29)</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins_jp&diff=456Begins jp2011-09-30T02:26:57Z<p>Oosugi: </p>
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<div>[[File:begins_jp.png]]<br />
*; 日本語リンク<br />
http://begins.neurotycho.org/begins.html<br />
*; NeurotychoBEGINSとは<br />
:最先端の脳の実際のデータを誰でも簡単に解析し、脳科学でいうところの「機能局在性」や「半球差」などを見てとる事ができるアプリケーションです。(ECoGという方法でニホンザルから計測しました。)<br />
:詳細は藤井直敬激筆の指南書にて(ページ下部からDL可能)<br />
:大幅アップデートを行いました.脱β!(2011/09/21)<br />
:以前のバージョンはここ([[http://wiki.neurotycho.org/Begins_jp_OLD]])です。<br />
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[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
[[File:Rank.png]]<br />
計測されているサルはBです.<br />
<br />
*;基本的な使い方<br />
#ラジオボタンの左側で条件1、右側で条件2を設定し、「描画」ボタンをクリックすることでその条件のデータを読み込み、条件間の違いを解析します。<br />
#解析の結果は左の脳の絵に図示されます。赤い点はその場所で条件1のほうが反応が有意に大きかったとき、青い点は条件2で反応が有意に大きかったとき、灰色の点は有意な差がみられなかた場所を示します。<br />
#どの条件のときにどの場所の反応が大きくなるかを色々な条件で試してみましょう。解析の絵は下のパネルを選択し「パネルへコピー」ボタンを押すと結果の絵が保存されるので色々な絵を見比べてみましょう。<br />
<br />
<br />
*; データについて<br />
# ”Day1” のデータは下記のURLにて公開してあります.詳細はそこを参照してください. (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day2" のデータは"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.<br />
# "Day3" のデータも"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.用いたサルはペアのサルも含めて同じです.<br />
# "Sleep" 条件は別の日に行った麻酔実験の麻酔時のデータを用いてます. <br />
:この麻酔実験のデータと詳細は近々アップロードします.<br />
<br />
*;解析について<br />
**;誰が<br />
:自分(ECoGを測定されているサル)と相手のどちらがエサを食べたか条件なのかを指定します.”どちらか”というのは誰が食べたのかを区別しないという意です.<br />
:*;どの手で<br />
:エサを食べたのを右と左のどちらで行った条件かを指定します."誰が"を相手にした場合は相手がどちらの手でエサを食べたのかを指定することになります.”どちらか”というのはどの手で食べたのかを区別しないという意です<br />
:*;ペアのサル<br />
:競合相手のサルは2通りいて,Aのサルは上位のサルでCのサルは下位のサルです.詳しい条件は下記のURLの指南書を参考にしてください.<br />
:*;衝突<br />
:"あり"とした場合,両サルが手の届く範囲にエサを置いた条件を指定することになります(上の図の下の条件)."なし"とした場合は片方のサルにだけ届く位置にエサが置かれました."どちらも"とした場合,エサの置かれた位置を区別しないという意です.<br />
<br />
:*; 時間窓<br />
:条件”エサ見せ”と”エサ置き”を基準とした時間でデータを解析します.時間はすべて500msの幅をもたせています.<br />
# "エサ見せ" と "前": エサ見せ開始時刻の前800msから前401msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "前後": エサ見せ開始時刻の前400msから前1msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "後": エサ見せ開始時刻の前後0msから後399msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前": エサ見せ終了時刻の前200msから後199msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前後": エサ見せ終了時刻の後200msから後599msまでの時間で解析をします.サルの腕の運動が始まる時間帯です.<br />
# "エサ置き" と "後": エサ見せ終了時刻の後600msから後999msまでの時間で解析をします.<br />
<br />
:*;信号 (周波数成分,バンドパワー)について<br />
:脳波を構成する成分を選択します.時間窓にFFTでパワースペクトルを求めています.<br />
# "デルタ": 2.5 Hzのパワースペクトル.<br />
# "シータ": 5 Hz から7.5 Hzのパワースペクトルの和<br />
# "アルファ": 10 Hz から 12.5 Hzのパワースペクトルの和. <br />
# "ベータ": 15 Hz から 30 Hzのパワースペクトルの和.<br />
# "低ガンマ": 32.5 Hz から 60 Hzのパワースペクトルの和.ただし電源ノイズがのる 50 Hzを除く.<br />
# "高ガンマ": 62.5 Hz から100 Hzのパワースペクトルの和..<br />
<br />
:*; 統計検定<br />
:MannWhitney テストをチャンネル毎に行います. 円の位置は電極の位置を示します.<br />
:条件を設定後,「描画」ボタンを押すと条件間で検定をかけ,以下の有意水準で有意差があったとみなせるチャンネルを色づけされます.<br />
# 赤色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.01).<br />
# 橙色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.05).<br />
# 水色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.05).<br />
# 青色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.01). <br />
<br />
*; 指南書<br />
:下記のURLからダウンロードできます.<br />
:http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf<br />
<br />
<br />
*;スタッフ<br />
** 企画,解析: Naoya Oosugi <br />
** Web アプリ開発: T M<br />
** 実験者: Toru Yanagawa<br />
** 総監督: Naotaka Fujii<br />
<br />
*;変更点<br />
: 時間窓を変更しました.<br />
: データを3日分に増やしました.<br />
: 有意水準を甘くしました.(2011/09/29)</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins_jp&diff=455Begins jp2011-09-29T08:30:15Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div>[[File:begins_jp.png]]<br />
*; 日本語リンク<br />
http://begins.neurotycho.org/begins.html<br />
*; NeurotychoBEGINSとは<br />
:最先端の脳の実際のデータを誰でも簡単に解析し、脳科学でいうところの「機能局在性」や「半球差」などを見てとる事ができるアプリケーションです。(ECoGという方法でニホンザルから計測しました。)<br />
:詳細はボス激筆の指南書にて(ページ下部からDL可能)<br />
:大幅アップデートを行いました.脱β!(2011/09/21)<br />
:以前のバージョンはここ([[http://wiki.neurotycho.org/Begins_jp_OLD]])です。<br />
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<br />
[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
[[File:Rank.png]]<br />
計測されているサルはBです.<br />
<br />
*;基本的な使い方<br />
#ラジオボタンの左側で条件1、右側で条件2を設定し、「描画」ボタンをクリックすることでその条件のデータを読み込み、条件間の違いを解析します。<br />
#解析の結果は左の脳の絵に図示されます。赤い点はその場所で条件1のほうが反応が有意に大きかったとき、青い点は条件2で反応が有意に大きかったとき、灰色の点は有意な差がみられなかた場所を示します。<br />
#どの条件のときにどの場所の反応が大きくなるかを色々な条件で試してみましょう。解析の絵は下のパネルを選択し「パネルへコピー」ボタンを押すと結果の絵が保存されるので色々な絵を見比べてみましょう。<br />
<br />
<br />
*; データについて<br />
# ”Day1” のデータは下記のURLにて公開してあります.詳細はそこを参照してください. (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day2" のデータは"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.<br />
# "Day3" のデータも"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.用いたサルはペアのサルも含めて同じです.<br />
# "Sleep" 条件は別の日に行った麻酔実験の麻酔時のデータを用いてます. <br />
:この麻酔実験のデータと詳細は近々アップロードします.<br />
<br />
*;解析について<br />
**;誰が<br />
:自分(ECoGを測定されているサル)と相手のどちらがエサを食べたか条件なのかを指定します.”どちらか”というのは誰が食べたのかを区別しないという意です.<br />
:*;どの手で<br />
:エサを食べたのを右と左のどちらで行った条件かを指定します."誰が"を相手にした場合は相手がどちらの手でエサを食べたのかを指定することになります.”どちらか”というのはどの手で食べたのかを区別しないという意です<br />
:*;ペアのサル<br />
:競合相手のサルは2通りいて,Aのサルは上位のサルでCのサルは下位のサルです.詳しい条件は下記のURLの指南書を参考にしてください.<br />
:*;衝突<br />
:"あり"とした場合,両サルが手の届く範囲にエサを置いた条件を指定することになります(上の図の下の条件)."なし"とした場合は片方のサルにだけ届く位置にエサが置かれました."どちらも"とした場合,エサの置かれた位置を区別しないという意です.<br />
<br />
:*; 時間窓<br />
:条件”エサ見せ”と”エサ置き”を基準とした時間でデータを解析します.時間はすべて500msの幅をもたせています.<br />
# "エサ見せ" と "前": エサ見せ開始時刻の前800msから前401msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "前後": エサ見せ開始時刻の前400msから前1msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "後": エサ見せ開始時刻の前後0msから後399msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前": エサ見せ終了時刻の前200msから後199msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前後": エサ見せ終了時刻の後200msから後599msまでの時間で解析をします.サルの腕の運動が始まる時間帯です.<br />
# "エサ置き" と "後": エサ見せ終了時刻の後600msから後999msまでの時間で解析をします.<br />
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:*;信号 (周波数成分,バンドパワー)について<br />
:脳波を構成する成分を選択します.時間窓にFFTでパワースペクトルを求めています.<br />
# "デルタ": 2.5 Hzのパワースペクトル.<br />
# "シータ": 5 Hz から7.5 Hzのパワースペクトルの和<br />
# "アルファ": 10 Hz から 12.5 Hzのパワースペクトルの和. <br />
# "ベータ": 15 Hz から 30 Hzのパワースペクトルの和.<br />
# "低ガンマ": 32.5 Hz から 60 Hzのパワースペクトルの和.ただし電源ノイズがのる 50 Hzを除く.<br />
# "高ガンマ": 62.5 Hz から100 Hzのパワースペクトルの和..<br />
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:*; 統計検定<br />
:MannWhitney テストをチャンネル毎に行います. 円の位置は電極の位置を示します.<br />
:条件を設定後,「描画」ボタンを押すと条件間で検定をかけ,以下の有意水準で有意差があったとみなせるチャンネルを色づけされます.<br />
# 赤色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.01).<br />
# 橙色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.05).<br />
# 水色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.05).<br />
# 青色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.01). <br />
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*; 指南書<br />
:下記のURLからダウンロードできます.<br />
:http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf<br />
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<br />
*;スタッフ<br />
** 企画,解析: Naoya Oosugi <br />
** Web アプリ開発: T M<br />
** 実験者: Toru Yanagawa<br />
** 総監督: Naotaka Fujii<br />
<br />
*;変更点<br />
: 時間窓を変更しました.<br />
: データを3日分に増やしました.<br />
: 有意水準を甘くしました.(2011/09/29)</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins_jp&diff=454Begins jp2011-09-29T07:51:45Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div>[[File:begins_jp.png]]<br />
*; 日本語リンク<br />
http://begins.neurotycho.org/begins.html<br />
*; NeurotychoBEGINSとは<br />
:最先端の脳の実際のデータを誰でも簡単に解析し、脳科学でいうところの「機能局在性」や「半球差」などを見てとる事ができるアプリケーションです。(ECoGという方法でニホンザルから計測しました。)<br />
:詳細はボス激筆の指南書にて(ページ下部からDL可能)<br />
:大幅アップデートを行いました.脱β!(2011/09/21)<br />
:以前のバージョンはここ([[http://wiki.neurotycho.org/Begins_jp_OLD]])です。<br />
<br />
<br />
<br />
[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
[[File:Rank.png]]<br />
計測されているサルはBです.<br />
<br />
*;基本的な使い方<br />
#ラジオボタンの左側で条件1、右側で条件2を設定し、「描画」ボタンをクリックすることでその条件のデータを読み込み、条件間の違いを解析します。<br />
#解析の結果は左の脳の絵に図示されます。赤い点はその場所で条件1のほうが反応が有意に大きかったとき、青い点は条件2で反応が有意に大きかったとき、灰色の点は有意な差がみられなかた場所を示します・<br />
#どの条件のときにどの場所の反応が大きくなるかを色々な条件で試してみましょう。解析の絵は下のパネルを選択し「パネルへコピー」ボタンを押すと結果の絵が保存されるので色々な絵を見比べてみましょう。<br />
<br />
<br />
*; データについて<br />
# ”Day1” のデータは下記のURLにて公開してあります.詳細はそこを参照してください. (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day2" のデータは"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.<br />
# "Day3" のデータも"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.用いたサルはペアのサルも含めて同じです.<br />
# "Sleep" 条件は別の日に行った麻酔実験の麻酔時のデータを用いてます. <br />
:この麻酔実験のデータと詳細は近々アップロードします.<br />
<br />
*;解析について<br />
**;誰が<br />
:自分(ECoGを測定されているサル)と相手のどちらがエサを食べたか条件なのかを指定します.”どちらか”というのは誰が食べたのかを区別しないという意です.<br />
:*;どの手で<br />
:エサを食べたのを右と左のどちらで行った条件かを指定します."誰が"を相手にした場合は相手がどちらの手でエサを食べたのかを指定することになります.”どちらか”というのはどの手で食べたのかを区別しないという意です<br />
:*;ペアのサル<br />
:競合相手のサルは2通りいて,Aのサルは上位のサルでCのサルは下位のサルです.詳しい条件は下記のURLの指南書を参考にしてください.<br />
:*;衝突<br />
:"あり"とした場合,両サルが手の届く範囲にエサを置いた条件を指定することになります(上の図の下の条件)."なし"とした場合は片方のサルにだけ届く位置にエサが置かれました."どちらも"とした場合,エサの置かれた位置を区別しないという意です.<br />
<br />
:*; 時間窓<br />
:条件”エサ見せ”と”エサ置き”を基準とした時間でデータを解析します.時間はすべて500msの幅をもたせています.<br />
# "エサ見せ" と "前": エサ見せ開始時刻の前800msから前401msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "前後": エサ見せ開始時刻の前400msから前1msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "後": エサ見せ開始時刻の前後0msから後399msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前": エサ見せ終了時刻の前200msから後199msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前後": エサ見せ終了時刻の後200msから後599msまでの時間で解析をします.サルの腕の運動が始まる時間帯です.<br />
# "エサ置き" と "後": エサ見せ終了時刻の後600msから後999msまでの時間で解析をします.<br />
<br />
:*;信号 (周波数成分,バンドパワー)について<br />
:脳波を構成する成分を選択します.時間窓にFFTでパワースペクトルを求めています.<br />
# "デルタ": 2.5 Hzのパワースペクトル.<br />
# "シータ": 5 Hz から7.5 Hzのパワースペクトルの和<br />
# "アルファ": 10 Hz から 12.5 Hzのパワースペクトルの和. <br />
# "ベータ": 15 Hz から 30 Hzのパワースペクトルの和.<br />
# "低ガンマ": 32.5 Hz から 60 Hzのパワースペクトルの和.ただし電源ノイズがのる 50 Hzを除く.<br />
# "高ガンマ": 62.5 Hz から100 Hzのパワースペクトルの和..<br />
<br />
:*; 統計検定<br />
:MannWhitney テストをチャンネル毎に行います. 円の位置は電極の位置を示します.<br />
:条件を設定後,「描画」ボタンを押すと条件間で検定をかけ,以下の有意水準で有意差があったとみなせるチャンネルを色づけされます.<br />
# 赤色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.01).<br />
# 橙色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.05).<br />
# 水色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.05).<br />
# 青色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.01). <br />
<br />
*; 指南書<br />
:下記のURLからダウンロードできます.<br />
:http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf<br />
<br />
<br />
*;スタッフ<br />
** 企画,解析: Naoya Oosugi <br />
** Web アプリ開発: T M<br />
** 実験者: Toru Yanagawa<br />
** 総監督: Naotaka Fujii<br />
<br />
*;変更点<br />
: 時間窓を変更しました.<br />
: データを3日分に増やしました.<br />
: 有意水準を甘くしました.(2011/09/29)</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=File:Begins_jp.png&diff=453File:Begins jp.png2011-09-29T07:51:09Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div></div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Main_Page&diff=452Main Page2011-09-29T07:49:42Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div>'''Wiki for Neurotycho.org'''<br />
<br />
Welcome to Wiki.Neurotycho!<br />
<br />
Project Tycho is named after Tycho Brahe. The project aims to share reliable massive neural and behavioral data for understanding brain mechanism. The dataset was recorded and distributed by Laboratory for Adaptive Intelligence, BSI, RIKEN. It is not only for neuroscientists but for everyone who is interested in learning neural mechanism.<br />
<br />
[[File:Ss.png]]<br />
<br />
<br />
CC0<br />
<br />
<br />
== Menu ==<br />
*Manual<br />
** [[Manual|Install Manual for Python and others]]<br />
** [[Manual_jp|Install manual for Python and others in Japanese]]<br />
<br><br />
*Web application<br />
**[[Begins]]<br />
**[[Begins_jp]]<br />
<br />
*Methods<br />
**[[Multi-dimensional Recording]]<br />
***[[ECoG]]<br />
***[[Motion Capture]]<br />
***[[Non-invasive Head Fixture]]<br />
***[[Head Free Eye Tracking]]<br />
***[[Surgical Procedure]]<br />
<br><br />
*Preliminary results<br />
**[[EEG-ECoG recording]]<br />
<br><br />
*FAQ for each Task<br />
**[[Visual Grating Task]]<br />
**[[Sleep Task]]<br />
**[[Social Competition Task]]<br />
**[[Emotional Movie Task]]<br />
**[[Food-Tracking Task]]<br />
**[[Spatial Map of ECoG array]]<br />
<br><br />
*Open Lab @ RIKEN BSI<br />
**[[Open Lab|What is Open Lab?]]<br />
<br />
<br />
----<br />
<br />
To the extent possible under law, neurotycho.org has waived all copyright and related or neighboring rights to downloadable dataset in Project Tycho. This work is published from: Japan.</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins_jp&diff=451Begins jp2011-09-29T07:44:10Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div>[[File:Begins.png]]<br />
*; 日本語リンク<br />
http://begins.neurotycho.org/begins.html<br />
*; NeurotychoBEGINSとは<br />
:最先端の脳の実際のデータを誰でも簡単に解析し、脳科学でいうところの「機能局在性」や「半球差」などを見てとる事ができるアプリケーションです。(ECoGという方法でニホンザルから計測しました。)<br />
:詳細はボス激筆の指南書にて(ページ下部からDL可能)<br />
:大幅アップデートを行いました.脱β!(2011/09/21)<br />
:以前のバージョンはここ([[http://wiki.neurotycho.org/Begins_jp_OLD]])です。<br />
<br />
<br />
<br />
[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
[[File:Rank.png]]<br />
計測されているサルはBです.<br />
<br />
*;基本的な使い方<br />
#ラジオボタンの左側で条件1、右側で条件2を設定し、「描画」ボタンをクリックすることでその条件のデータを読み込み、条件間の違いを解析します。<br />
#解析の結果は左の脳の絵に図示されます。赤い点はその場所で条件1のほうが反応が有意に大きかったとき、青い点は条件2で反応が有意に大きかったとき、灰色の点は有意な差がみられなかた場所を示します・<br />
#どの条件のときにどの場所の反応が大きくなるかを色々な条件で試してみましょう。解析の絵は下のパネルを選択し「パネルへコピー」ボタンを押すと結果の絵が保存されるので色々な絵を見比べてみましょう。<br />
<br />
<br />
*; データについて<br />
# ”Day1” のデータは下記のURLにて公開してあります.詳細はそこを参照してください. (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day2" のデータは"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.<br />
# "Day3" のデータも"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.用いたサルはペアのサルも含めて同じです.<br />
# "Sleep" 条件は別の日に行った麻酔実験の麻酔時のデータを用いてます. <br />
:この麻酔実験のデータと詳細は近々アップロードします.<br />
<br />
*;解析について<br />
**;誰が<br />
:自分(ECoGを測定されているサル)と相手のどちらがエサを食べたか条件なのかを指定します.”どちらか”というのは誰が食べたのかを区別しないという意です.<br />
:*;どの手で<br />
:エサを食べたのを右と左のどちらで行った条件かを指定します."誰が"を相手にした場合は相手がどちらの手でエサを食べたのかを指定することになります.”どちらか”というのはどの手で食べたのかを区別しないという意です<br />
:*;ペアのサル<br />
:競合相手のサルは2通りいて,Aのサルは上位のサルでCのサルは下位のサルです.詳しい条件は下記のURLの指南書を参考にしてください.<br />
:*;衝突<br />
:"あり"とした場合,両サルが手の届く範囲にエサを置いた条件を指定することになります(上の図の下の条件)."なし"とした場合は片方のサルにだけ届く位置にエサが置かれました."どちらも"とした場合,エサの置かれた位置を区別しないという意です.<br />
<br />
:*; 時間窓<br />
:条件”エサ見せ”と”エサ置き”を基準とした時間でデータを解析します.時間はすべて500msの幅をもたせています.<br />
# "エサ見せ" と "前": エサ見せ開始時刻の前800msから前401msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "前後": エサ見せ開始時刻の前400msから前1msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "後": エサ見せ開始時刻の前後0msから後399msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前": エサ見せ終了時刻の前200msから後199msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前後": エサ見せ終了時刻の後200msから後599msまでの時間で解析をします.サルの腕の運動が始まる時間帯です.<br />
# "エサ置き" と "後": エサ見せ終了時刻の後600msから後999msまでの時間で解析をします.<br />
<br />
:*;信号 (周波数成分,バンドパワー)について<br />
:脳波を構成する成分を選択します.時間窓にFFTでパワースペクトルを求めています.<br />
# "デルタ": 2.5 Hzのパワースペクトル.<br />
# "シータ": 5 Hz から7.5 Hzのパワースペクトルの和<br />
# "アルファ": 10 Hz から 12.5 Hzのパワースペクトルの和. <br />
# "ベータ": 15 Hz から 30 Hzのパワースペクトルの和.<br />
# "低ガンマ": 32.5 Hz から 60 Hzのパワースペクトルの和.ただし電源ノイズがのる 50 Hzを除く.<br />
# "高ガンマ": 62.5 Hz から100 Hzのパワースペクトルの和..<br />
<br />
:*; 統計検定<br />
:MannWhitney テストをチャンネル毎に行います. 円の位置は電極の位置を示します.<br />
:条件を設定後,「描画」ボタンを押すと条件間で検定をかけ,以下の有意水準で有意差があったとみなせるチャンネルを色づけされます.<br />
# 赤色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.01).<br />
# 橙色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.05).<br />
# 水色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.05).<br />
# 青色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.01). <br />
<br />
*; 指南書<br />
:下記のURLからダウンロードできます.<br />
:http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf<br />
<br />
<br />
*;スタッフ<br />
** 企画,解析: Naoya Oosugi <br />
** Web アプリ開発: T M<br />
** 実験者: Toru Yanagawa<br />
** 総監督: Naotaka Fujii<br />
<br />
*;変更点<br />
: 時間窓を変更しました.<br />
: データを3日分に増やしました.<br />
: 有意水準を甘くしました.(2011/09/29)</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins_jp&diff=450Begins jp2011-09-29T07:43:20Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div>[[File:Begins.png]]<br />
<br />
*; NeurotychoBEGINSとは<br />
:最先端の脳の実際のデータを誰でも簡単に解析し、脳科学でいうところの「機能局在性」や「半球差」などを見てとる事ができるアプリケーションです。(ECoGという方法でニホンザルから計測しました。)<br />
:詳細はボス激筆の指南書にて(ページ下部からDL可能)<br />
:大幅アップデートを行いました.脱β!(2011/09/21)<br />
:以前のバージョンはここ([[http://wiki.neurotycho.org/Begins_jp_OLD]])です。<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/begins.html<br />
<br />
[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
[[File:Rank.png]]<br />
計測されているサルはBです.<br />
<br />
*;基本的な使い方<br />
#ラジオボタンの左側で条件1、右側で条件2を設定し、「描画」ボタンをクリックすることでその条件のデータを読み込み、条件間の違いを解析します。<br />
#解析の結果は左の脳の絵に図示されます。赤い点はその場所で条件1のほうが反応が有意に大きかったとき、青い点は条件2で反応が有意に大きかったとき、灰色の点は有意な差がみられなかた場所を示します・<br />
#どの条件のときにどの場所の反応が大きくなるかを色々な条件で試してみましょう。解析の絵は下のパネルを選択し「パネルへコピー」ボタンを押すと結果の絵が保存されるので色々な絵を見比べてみましょう。<br />
<br />
<br />
*; データについて<br />
# ”Day1” のデータは下記のURLにて公開してあります.詳細はそこを参照してください. (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day2" のデータは"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.<br />
# "Day3" のデータも"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.用いたサルはペアのサルも含めて同じです.<br />
# "Sleep" 条件は別の日に行った麻酔実験の麻酔時のデータを用いてます. <br />
:この麻酔実験のデータと詳細は近々アップロードします.<br />
<br />
*;解析について<br />
**;誰が<br />
:自分(ECoGを測定されているサル)と相手のどちらがエサを食べたか条件なのかを指定します.”どちらか”というのは誰が食べたのかを区別しないという意です.<br />
:*;どの手で<br />
:エサを食べたのを右と左のどちらで行った条件かを指定します."誰が"を相手にした場合は相手がどちらの手でエサを食べたのかを指定することになります.”どちらか”というのはどの手で食べたのかを区別しないという意です<br />
:*;ペアのサル<br />
:競合相手のサルは2通りいて,Aのサルは上位のサルでCのサルは下位のサルです.詳しい条件は下記のURLの指南書を参考にしてください.<br />
:*;衝突<br />
:"あり"とした場合,両サルが手の届く範囲にエサを置いた条件を指定することになります(上の図の下の条件)."なし"とした場合は片方のサルにだけ届く位置にエサが置かれました."どちらも"とした場合,エサの置かれた位置を区別しないという意です.<br />
<br />
:*; 時間窓<br />
:条件”エサ見せ”と”エサ置き”を基準とした時間でデータを解析します.時間はすべて500msの幅をもたせています.<br />
# "エサ見せ" と "前": エサ見せ開始時刻の前800msから前401msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "前後": エサ見せ開始時刻の前400msから前1msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "後": エサ見せ開始時刻の前後0msから後399msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前": エサ見せ終了時刻の前200msから後199msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前後": エサ見せ終了時刻の後200msから後599msまでの時間で解析をします.サルの腕の運動が始まる時間帯です.<br />
# "エサ置き" と "後": エサ見せ終了時刻の後600msから後999msまでの時間で解析をします.<br />
<br />
:*;信号 (周波数成分,バンドパワー)について<br />
:脳波を構成する成分を選択します.時間窓にFFTでパワースペクトルを求めています.<br />
# "デルタ": 2.5 Hzのパワースペクトル.<br />
# "シータ": 5 Hz から7.5 Hzのパワースペクトルの和<br />
# "アルファ": 10 Hz から 12.5 Hzのパワースペクトルの和. <br />
# "ベータ": 15 Hz から 30 Hzのパワースペクトルの和.<br />
# "低ガンマ": 32.5 Hz から 60 Hzのパワースペクトルの和.ただし電源ノイズがのる 50 Hzを除く.<br />
# "高ガンマ": 62.5 Hz から100 Hzのパワースペクトルの和..<br />
<br />
:*; 統計検定<br />
:MannWhitney テストをチャンネル毎に行います. 円の位置は電極の位置を示します.<br />
:条件を設定後,「描画」ボタンを押すと条件間で検定をかけ,以下の有意水準で有意差があったとみなせるチャンネルを色づけされます.<br />
# 赤色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.01).<br />
# 橙色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.05).<br />
# 水色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.05).<br />
# 青色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.01). <br />
<br />
*; 指南書<br />
:下記のURLからダウンロードできます.<br />
:http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf<br />
<br />
<br />
*;スタッフ<br />
** 企画,解析: Naoya Oosugi <br />
** Web アプリ開発: T M<br />
** 実験者: Toru Yanagawa<br />
** 総監督: Naotaka Fujii<br />
<br />
*;変更点<br />
: 時間窓を変更しました.<br />
: データを3日分に増やしました.<br />
: 有意水準を甘くしました.(2011/09/29)</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=File:Rank.png&diff=449File:Rank.png2011-09-29T07:38:19Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div></div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins_jp&diff=448Begins jp2011-09-29T03:28:27Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div>[[File:Begins.png]]<br />
<br />
*; NeurotychoBEGINSとは<br />
:最先端の脳の実際のデータを誰でも簡単に解析し、脳科学でいうところの「機能局在性」や「半球差」などを見てとる事ができるアプリケーションです。(ECoGという方法でニホンザルから計測しました。)<br />
:詳細はボス激筆の指南書にて(ページ下部からDL可能)<br />
:大幅アップデートを行いました.脱β!(2011/09/21)<br />
:以前のバージョンはここ([[http://wiki.neurotycho.org/Begins_jp_OLD]])です。<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/begins.html<br />
<br />
[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
*;基本的な使い方<br />
#ラジオボタンの左側で条件1、右側で条件2を設定し、「描画」ボタンをクリックすることでその条件のデータを読み込み、条件間の違いを解析します。<br />
#解析の結果は左の脳の絵に図示されます。赤い点はその場所で条件1のほうが反応が有意に大きかったとき、青い点は条件2で反応が有意に大きかったとき、灰色の点は有意な差がみられなかた場所を示します・<br />
#どの条件のときにどの場所の反応が大きくなるかを色々な条件で試してみましょう。解析の絵は下のパネルを選択し「パネルへコピー」ボタンを押すと結果の絵が保存されるので色々な絵を見比べてみましょう。<br />
<br />
<br />
*; データについて<br />
# ”Day1” のデータは下記のURLにて公開してあります.詳細はそこを参照してください. (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day2" のデータは"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.<br />
# "Day3" のデータも"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.用いたサルはペアのサルも含めて同じです.<br />
# "Sleep" 条件は別の日に行った麻酔実験の麻酔時のデータを用いてます. <br />
:この麻酔実験のデータと詳細は近々アップロードします.<br />
<br />
*;解析について<br />
**;誰が<br />
:自分(ECoGを測定されているサル)と相手のどちらがエサを食べたか条件なのかを指定します.”どちらか”というのは誰が食べたのかを区別しないという意です.<br />
:*;どの手で<br />
:エサを食べたのを右と左のどちらで行った条件かを指定します."誰が"を相手にした場合は相手がどちらの手でエサを食べたのかを指定することになります.”どちらか”というのはどの手で食べたのかを区別しないという意です<br />
:*;ペアのサル<br />
:競合相手のサルは2通りいて,Aのサルは上位のサルでCのサルは下位のサルです.詳しい条件は下記のURLの指南書を参考にしてください.<br />
:*;衝突<br />
:"あり"とした場合,両サルが手の届く範囲にエサを置いた条件を指定することになります(上の図の下の条件)."なし"とした場合は片方のサルにだけ届く位置にエサが置かれました."どちらも"とした場合,エサの置かれた位置を区別しないという意です.<br />
<br />
:*; 時間窓<br />
:条件”エサ見せ”と”エサ置き”を基準とした時間でデータを解析します.時間はすべて500msの幅をもたせています.<br />
# "エサ見せ" と "前": エサ見せ開始時刻の前800msから前401msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "前後": エサ見せ開始時刻の前400msから前1msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "後": エサ見せ開始時刻の前後0msから後399msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前": エサ見せ終了時刻の前200msから後199msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前後": エサ見せ終了時刻の後200msから後599msまでの時間で解析をします.サルの腕の運動が始まる時間帯です.<br />
# "エサ置き" と "後": エサ見せ終了時刻の後600msから後999msまでの時間で解析をします.<br />
<br />
:*;信号 (周波数成分,バンドパワー)について<br />
:脳波を構成する成分を選択します.時間窓にFFTでパワースペクトルを求めています.<br />
# "デルタ": 2 Hzのパワースペクトル.<br />
# "シータ": 4 Hz から6 Hzのパワースペクトルの和<br />
# "アルファ": 8 Hz から 12 Hzのパワースペクトルの和. <br />
# "ベータ": 14 Hz から 28 Hzのパワースペクトルの和.<br />
# "低ガンマ": 30 Hz から 58 Hzのパワースペクトルの和.ただし電源ノイズがのる 50 Hzを除く.<br />
# "高ガンマ": 60 Hz から100 Hzのパワースペクトルの和..<br />
<br />
:*; 統計検定<br />
:MannWhitney テストをチャンネル毎に行います. 円の位置は電極の位置を示します.<br />
:条件を設定後,「描画」ボタンを押すと条件間で検定をかけ,以下の有意水準で有意差があったとみなせるチャンネルを色づけされます.<br />
# 赤色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.01).<br />
# 橙色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.05).<br />
# 水色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.05).<br />
# 青色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.01). <br />
<br />
*; 指南書<br />
:下記のURLからダウンロードできます.<br />
:http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf<br />
<br />
<br />
*;スタッフ<br />
** 企画,解析: Naoya Oosugi <br />
** Web アプリ開発: T M<br />
** 実験者: Toru Yanagawa<br />
** 総監督: Naotaka Fujii<br />
<br />
*;変更点<br />
: 時間窓を変更しました.<br />
: データを3日分に増やしました.<br />
: 有意水準を甘くしました.(2011/09/29)</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins_jp_OLD&diff=447Begins jp OLD2011-09-29T03:02:39Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div>[[File:Begins.png]]<br />
<br />
*; NeurotychoBEGINSとは<br />
:最先端の脳の実際のデータを誰でも簡単に解析し、脳科学でいうところの「機能局在性」や「半球差」などを見てとる事ができるアプリケーションです。(ECoGという方法でニホンザルから計測しました。)<br />
:詳細はボス激筆の指南書にて(ページ下部からDL可能)<br />
:現在はβバージョンです。<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/old/begins.html<br />
<br />
[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
*;基本的な使い方<br />
#ラジオボタンの左側で条件1、右側で条件2を設定し、「描画」ボタンをクリックすることでその条件のデータを読み込み、条件間の違いを解析します。<br />
#解析の結果は左の脳の絵に図示されます。赤い点はその場所で条件1のほうが反応が有意に大きかったとき、青い点は条件2で反応が有意に大きかったとき、灰色の点は有意な差がみられなかた場所を示します・<br />
#どの条件のときにどの場所の反応が大きくなるかを色々な条件で試してみましょう。解析の絵は下のパネルを選択し「パネルへコピー」ボタンを押すと結果の絵が保存されるので色々な絵を見比べてみましょう。<br />
<br />
<br />
*; データについて<br />
# ”Day1” のデータは下記のURLにて公開してあります.詳細はそこを参照してください. (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day2" のデータは"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.<br />
# "Sleep" 条件は別の日に行った麻酔実験の麻酔時のデータを用いてます. <br />
:この麻酔実験のデータと詳細は近々アップロードします.<br />
<br />
*;解析について<br />
**;誰が<br />
:自分(ECoGを測定されているサル)と相手のどちらがエサを食べたか条件なのかを指定します.”どちらか”というのは誰が食べたのかを区別しないという意です.<br />
:*;どの手で<br />
:エサを食べたのを右と左のどちらで行った条件かを指定します."誰が"を相手にした場合は相手がどちらの手でエサを食べたのかを指定することになります.”どちらか”というのはどの手で食べたのかを区別しないという意です<br />
:*;ペアのサル<br />
:競合相手のサルは2通りいて,Aのサルは上位のサルでCのサルは下位のサルです.詳しい条件は下記のURLの指南書を参考にしてください.<br />
:*;衝突<br />
:"あり"とした場合,両サルが手の届く範囲にエサを置いた条件を指定することになります(上の図の下の条件)."なし"とした場合は片方のサルにだけ届く位置にエサが置かれました."どちらも"とした場合,エサの置かれた位置を区別しないという意です.<br />
<br />
:*; 時間窓<br />
:条件”エサ見せ”と”エサ置き”を基準とした時間でデータを解析します.時間はすべて500msの幅をもたせています.<br />
# "エサ見せ" と "前": エサ見せの前750msから前249msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "前後": エサ見せの前250msから後249msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "後": エサ見せの後250msから後499msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前": エサ置きの前1000msから前501msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前後": エサ置きの前500msから前1msまでの時間で解析をします.サルの腕の運動が始まる時間帯です.<br />
# "エサ置き" と "後": エサ置きの前後0msから後499msまでの時間で解析をします.<br />
<br />
:*;信号 (周波数成分,バンドパワー)について<br />
:脳波を構成する成分を選択します.時間窓にFFTでパワースペクトルを求めています.<br />
# "デルタ": 2 Hzのパワースペクトル.<br />
# "シータ": 4 Hz から6 Hzのパワースペクトルの和<br />
# "アルファ": 8 Hz から 12 Hzのパワースペクトルの和. <br />
# "ベータ": 14 Hz から 28 Hzのパワースペクトルの和.<br />
# "低ガンマ": 30 Hz から 58 Hzのパワースペクトルの和.ただし電源ノイズがのる 50 Hzを除く.<br />
# "高ガンマ": 60 Hz から100 Hzのパワースペクトルの和..<br />
<br />
:*; 統計検定<br />
:MannWhitney テストをチャンネル毎に行います. 円の位置は電極の位置を示します.<br />
:条件を設定後,「描画」ボタンを押すと条件間で検定をかけ,以下の有意水準で有意差があったとみなせるチャンネルを色づけされます.<br />
# 赤色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.0001).<br />
# 橙色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.001).<br />
# 水色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.001).<br />
# 青色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.0001). <br />
<br />
*; 指南書<br />
:下記のURLからダウンロードできます.<br />
:http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf<br />
<br />
<br />
*スタッフ<br />
** 企画,解析: Naoya Oosugi <br />
** Web アプリ開発: T M<br />
** 実験者: Toru Yanagawa<br />
** 総監督: Naotaka Fujii</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins_jp_OLD&diff=446Begins jp OLD2011-09-29T03:00:34Z<p>Oosugi: Created page with "File:Begins.png *; NeurotychoBEGINSとは :最先端の脳の実際のデータを誰でも簡単に解析し、脳科学でいうところの「機能局在性」や「半..."</p>
<hr />
<div>[[File:Begins.png]]<br />
<br />
*; NeurotychoBEGINSとは<br />
:最先端の脳の実際のデータを誰でも簡単に解析し、脳科学でいうところの「機能局在性」や「半球差」などを見てとる事ができるアプリケーションです。(ECoGという方法でニホンザルから計測しました。)<br />
:詳細はボス激筆の指南書にて(ページ下部からDL可能)<br />
:現在はβバージョンです。<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/begins.html<br />
<br />
[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
*;基本的な使い方<br />
#ラジオボタンの左側で条件1、右側で条件2を設定し、「描画」ボタンをクリックすることでその条件のデータを読み込み、条件間の違いを解析します。<br />
#解析の結果は左の脳の絵に図示されます。赤い点はその場所で条件1のほうが反応が有意に大きかったとき、青い点は条件2で反応が有意に大きかったとき、灰色の点は有意な差がみられなかた場所を示します・<br />
#どの条件のときにどの場所の反応が大きくなるかを色々な条件で試してみましょう。解析の絵は下のパネルを選択し「パネルへコピー」ボタンを押すと結果の絵が保存されるので色々な絵を見比べてみましょう。<br />
<br />
<br />
*; データについて<br />
# ”Day1” のデータは下記のURLにて公開してあります.詳細はそこを参照してください. (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day2" のデータは"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.<br />
# "Sleep" 条件は別の日に行った麻酔実験の麻酔時のデータを用いてます. <br />
:この麻酔実験のデータと詳細は近々アップロードします.<br />
<br />
*;解析について<br />
**;誰が<br />
:自分(ECoGを測定されているサル)と相手のどちらがエサを食べたか条件なのかを指定します.”どちらか”というのは誰が食べたのかを区別しないという意です.<br />
:*;どの手で<br />
:エサを食べたのを右と左のどちらで行った条件かを指定します."誰が"を相手にした場合は相手がどちらの手でエサを食べたのかを指定することになります.”どちらか”というのはどの手で食べたのかを区別しないという意です<br />
:*;ペアのサル<br />
:競合相手のサルは2通りいて,Aのサルは上位のサルでCのサルは下位のサルです.詳しい条件は下記のURLの指南書を参考にしてください.<br />
:*;衝突<br />
:"あり"とした場合,両サルが手の届く範囲にエサを置いた条件を指定することになります(上の図の下の条件)."なし"とした場合は片方のサルにだけ届く位置にエサが置かれました."どちらも"とした場合,エサの置かれた位置を区別しないという意です.<br />
<br />
:*; 時間窓<br />
:条件”エサ見せ”と”エサ置き”を基準とした時間でデータを解析します.時間はすべて500msの幅をもたせています.<br />
# "エサ見せ" と "前": エサ見せの前750msから前249msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "前後": エサ見せの前250msから後249msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "後": エサ見せの後250msから後499msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前": エサ置きの前1000msから前501msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前後": エサ置きの前500msから前1msまでの時間で解析をします.サルの腕の運動が始まる時間帯です.<br />
# "エサ置き" と "後": エサ置きの前後0msから後499msまでの時間で解析をします.<br />
<br />
:*;信号 (周波数成分,バンドパワー)について<br />
:脳波を構成する成分を選択します.時間窓にFFTでパワースペクトルを求めています.<br />
# "デルタ": 2 Hzのパワースペクトル.<br />
# "シータ": 4 Hz から6 Hzのパワースペクトルの和<br />
# "アルファ": 8 Hz から 12 Hzのパワースペクトルの和. <br />
# "ベータ": 14 Hz から 28 Hzのパワースペクトルの和.<br />
# "低ガンマ": 30 Hz から 58 Hzのパワースペクトルの和.ただし電源ノイズがのる 50 Hzを除く.<br />
# "高ガンマ": 60 Hz から100 Hzのパワースペクトルの和..<br />
<br />
:*; 統計検定<br />
:MannWhitney テストをチャンネル毎に行います. 円の位置は電極の位置を示します.<br />
:条件を設定後,「描画」ボタンを押すと条件間で検定をかけ,以下の有意水準で有意差があったとみなせるチャンネルを色づけされます.<br />
# 赤色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.0001).<br />
# 橙色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.001).<br />
# 水色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.001).<br />
# 青色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.0001). <br />
<br />
*; 指南書<br />
:下記のURLからダウンロードできます.<br />
:http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf<br />
<br />
<br />
*スタッフ<br />
** 企画,解析: Naoya Oosugi <br />
** Web アプリ開発: T M<br />
** 実験者: Toru Yanagawa<br />
** 総監督: Naotaka Fujii</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins_jp&diff=444Begins jp2011-09-25T06:52:57Z<p>Oosugi: </p>
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<div>[[File:Begins.png]]<br />
<br />
*; NeurotychoBEGINSとは<br />
:最先端の脳の実際のデータを誰でも簡単に解析し、脳科学でいうところの「機能局在性」や「半球差」などを見てとる事ができるアプリケーションです。(ECoGという方法でニホンザルから計測しました。)<br />
:詳細はボス激筆の指南書にて(ページ下部からDL可能)<br />
:現在はβバージョンです。<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/begins.html<br />
<br />
[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
*; データについて<br />
# ”Day1” のデータは下記のURLにて公開してあります.詳細はそこを参照してください. (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day2" のデータは"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.<br />
# "Sleep" 条件は別の日に行った麻酔実験の麻酔時のデータを用いてます. <br />
:この麻酔実験のデータと詳細は近々アップロードします.<br />
<br />
*;解析について<br />
**;誰が<br />
:自分(ECoGを測定されているサル)と相手のどちらがエサを食べたか条件なのかを指定します.”どちらか”というのは誰が食べたのかを区別しないという意です.<br />
:*;どの手で<br />
:エサを食べたのを右と左のどちらで行った条件かを指定します."誰が"を相手にした場合は相手がどちらの手でエサを食べたのかを指定することになります.”どちらか”というのはどの手で食べたのかを区別しないという意です<br />
:*;ペアのサル<br />
:競合相手のサルは2通りいて,Aのサルは上位のサルでCのサルは下位のサルです.詳しい条件は下記のURLの指南書を参考にしてください.<br />
:*;衝突<br />
:"あり"とした場合,両サルが手の届く範囲にエサを置いた条件を指定することになります(上の図の下の条件)."なし"とした場合は片方のサルにだけ届く位置にエサが置かれました."どちらも"とした場合,エサの置かれた位置を区別しないという意です.<br />
<br />
:*; 時間窓<br />
:条件”エサ見せ”と”エサ置き”を基準とした時間でデータを解析します.時間はすべて500msの幅をもたせています.<br />
# "エサ見せ" と "前": エサ見せの前750msから前249msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "前後": エサ見せの前250msから後249msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "後": エサ見せの後250msから後499msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前": エサ置きの前1000msから前501msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前後": エサ置きの前500msから前1msまでの時間で解析をします.サルの腕の運動が始まる時間帯です.<br />
# "エサ置き" と "後": エサ置きの前後0msから後499msまでの時間で解析をします.<br />
<br />
:*;信号 (周波数成分,バンドパワー)について<br />
:脳波を構成する成分を選択します.時間窓にFFTでパワースペクトルを求めています.<br />
# "デルタ": 2 Hzのパワースペクトル.<br />
# "シータ": 4 Hz から6 Hzのパワースペクトルの和<br />
# "アルファ": 8 Hz から 12 Hzのパワースペクトルの和. <br />
# "ベータ": 14 Hz から 28 Hzのパワースペクトルの和.<br />
# "低ガンマ": 30 Hz から 58 Hzのパワースペクトルの和.ただし電源ノイズがのる 50 Hzを除く.<br />
# "高ガンマ": 60 Hz から100 Hzのパワースペクトルの和..<br />
<br />
:*; 統計検定<br />
:MannWhitney テストをチャンネル毎に行います. 円の位置は電極の位置を示します.<br />
:条件を設定後,「描画」ボタンを押すと条件間で検定をかけ,以下の有意水準で有意差があったとみなせるチャンネルを色づけされます.<br />
# 赤色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.0001).<br />
# 橙色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.001).<br />
# 水色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.001).<br />
# 青色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.0001). <br />
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*; 指南書<br />
:下記のURLからダウンロードできます.<br />
:http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf<br />
<br />
<br />
*スタッフ<br />
** 企画,解析: Naoya Oosugi <br />
** Web アプリ開発: T M<br />
** 実験者: Toru Yanagawa<br />
** 総監督: Naotaka Fujii</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins&diff=443Begins2011-09-25T06:52:26Z<p>Oosugi: </p>
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<div>[[File:Begins.png]]<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/<br />
<br />
[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
*; Data<br />
# "Day 1" is a dataset already uploaded on Neurotycho (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day 2" is a dataset recorded on the next day of "Day1".<br />
# "Sleep" condition is a dataset in "Sleep task" recorded on separate day. <br />
:Additional data will be uploaded soon.<br />
<br />
*;Analysis<br />
**; Time window<br />
:There are three time windows (size=500ms) prepared for each of two task events, "Show food" and "Food place".<br />
# "Show food" + "Early": window was set between -750 ms and -249 ms around "Show food" event.<br />
# "Show food" + "Middle": window was set between -250 ms and +249 ms around "Show food" event.<br />
# "Show food" + "Late": window was set between +250 ms and +750 ms around "Show food" event.<br />
# "Food place" + "Early": window was set between-1000 ms and -501 ms around "Food place" event.<br />
# "Food place" + "Middle": window was set between -500 ms and -1 ms around "Food place" event. At some point during the window, monkey had already started reaching motion.<br />
# "Food place" + "Late": window was set between 0 ms and + 499 ms around "Food place" event.<br />
<br />
:*; Frequency band power<br />
:Power spectrum of ECoG data at each time window was calculated by FFT.<br />
# "Delta": power spectrum at 2 Hz.<br />
# "Theta": power spectrum summated within 4 Hz and 6 Hz.<br />
# "Alpha": power spectrum summated within 8 Hz and 12 Hz. <br />
# "Beta": power spectrum summated within 14 Hz and 28 Hz.<br />
# "Low Gamma": power spectrum summated within 30 Hz and 58 Hz except 50 Hz.<br />
# "High Gamma": power spectrum summated within 60 Hz and 100 Hz.<br />
<br />
:*; Statistics test<br />
:MannWhitney test will be used for statistical comparison. Circles indicate locations of electrode.<br />
:After setting all parameters and when "Draw" button is pressed, statistical comparison will be made. Results will be shown by color by following rules.<br />
# Red: condition 1 > condition 2 (p < 0.0001).<br />
# Brown: condition 1 > condition 2 (p < 0.001).<br />
# Light blue: condition 2 > condition 1 (p < 0.001).<br />
# Blue: condition 2 > condition 1 (p < 0.0001). <br />
<br />
*; Guide (in Japanese)<br />
:Please download BEGINS Guidebook from a link below.<br />
:http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf<br />
:English guidebook will be released soon.<br />
<br />
CONTRIBUTORS<br />
** Original Application Design, Data Preparation: Naoya Oosugi <br />
** Web application: T M<br />
** Data Collection: Toru Yanagawa<br />
** General Direction: Naotaka Fujii</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins_jp&diff=441Begins jp2011-09-20T06:37:04Z<p>Oosugi: </p>
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<div>[[File:Begins.png]]<br />
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http://begins.neurotycho.org/begins.html<br />
<br />
[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
*; データについて<br />
# ”Day1” のデータは下記のURLにて公開してあります.詳細はそこを参照してください. (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day2" のデータは"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.<br />
# "Sleep" 条件は別の日に行った麻酔実験の麻酔時のデータを用いてます. <br />
:この麻酔実験のデータと詳細は近々アップロードします.<br />
<br />
*;解析について<br />
**;誰が<br />
:自分(ECoGを測定されているサル)と相手のどちらがエサを食べたか条件なのかを指定します.”どちらか”というのは誰が食べたのかを区別しないという意です.<br />
:*;どの手で<br />
:エサを食べたのを右と左のどちらで行った条件かを指定します."誰が"を相手にした場合は相手がどちらの手でエサを食べたのかを指定することになります.”どちらか”というのはどの手で食べたのかを区別しないという意です<br />
:*;ペアのサル<br />
:競合相手のサルは2通りいて,Aのサルは上位のサルでCのサルは下位のサルです.詳しい条件は下記のURLの指南書を参考にしてください.<br />
:*;衝突<br />
:"あり"とした場合,両サルが手の届く範囲にエサを置いた条件を指定することになります(上の図の下の条件)."なし"とした場合は片方のサルにだけ届く位置にエサが置かれました."どちらも"とした場合,エサの置かれた位置を区別しないという意です.<br />
<br />
:*; 時間窓<br />
:条件”エサ見せ”と”エサ置き”を基準とした時間でデータを解析します.時間はすべて500msの幅をもたせています.<br />
# "エサ見せ" と "前": エサ見せの前750msから前249msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "前後": エサ見せの前250msから後249msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "後": エサ見せの後250msから後499msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前": エサ置きの前1000msから前501msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前後": エサ置きの前500msから前1msまでの時間で解析をします.サルの腕の運動が始まる時間帯です.<br />
# "エサ置き" と "後": エサ置きの前後0msから後499msまでの時間で解析をします.<br />
<br />
:*;信号 (周波数成分,バンドパワー)について<br />
:脳波を構成する成分を選択します.時間窓にFFTでパワースペクトルを求めています.<br />
# "デルタ": 2 Hzのパワースペクトル.<br />
# "シータ": 4 Hz から6 Hzのパワースペクトルの和<br />
# "アルファ": 8 Hz から 12 Hzのパワースペクトルの和. <br />
# "ベータ": 14 Hz から 28 Hzのパワースペクトルの和.<br />
# "低ガンマ": 30 Hz から 58 Hzのパワースペクトルの和.ただし電源ノイズがのる 50 Hzを除く.<br />
# "高ガンマ": 60 Hz から100 Hzのパワースペクトルの和..<br />
<br />
:*; 統計検定<br />
:MannWhitney テストをチャンネル毎に行います. 円の位置は電極の位置を示します.<br />
:条件を設定後,「描画」ボタンを押すと条件間で検定をかけ,以下の有意水準で有意差があったとみなせるチャンネルを色づけされます.<br />
# 赤色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.0001).<br />
# 橙色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.001).<br />
# 水色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.001).<br />
# 青色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.0001). <br />
<br />
*; 指南書<br />
:下記のURLからダウンロードできます.<br />
:http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf<br />
<br />
<br />
*スタッフ<br />
** 企画,解析: Naoya Oosugi <br />
** Web アプリ開発: Takaharu Matsuo<br />
** 実験者: Toru Yanagawa<br />
** 総監督: Naotaka Fujii</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins_jp&diff=440Begins jp2011-09-20T06:36:35Z<p>Oosugi: </p>
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<div>[[File:Begins.png]]<br />
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http://begins.neurotycho.org/begins.html<br />
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[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
*; データについて<br />
# ”Day1” のデータは下記のURLにて公開してあります.詳細はそこを参照してください. (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day2" のデータは"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.<br />
# "Sleep" 条件は別の日に行った麻酔実験の麻酔時のデータを用いてます. <br />
:この麻酔実験のデータと詳細は近々アップロードします.<br />
<br />
*;解析について<br />
**;誰が<br />
:自分(ECoGを測定されているサル)と相手のどちらがエサを食べたか条件なのかを指定します.”どちらか”というのは誰が食べたのかを区別しないという意です.<br />
:*;どの手で<br />
:エサを食べたのを右と左のどちらで行った条件かを指定します."誰が"を相手にした場合は相手がどちらの手でエサを食べたのかを指定することになります.”どちらか”というのはどの手で食べたのかを区別しないという意です<br />
:*;ペアのサル<br />
競合相手のサルは2通りいて,Aのサルは上位のサルでCのサルは下位のサルです.詳しい条件は下記のURLの指南書を参考にしてください.<br />
:*;衝突<br />
"あり"とした場合,両サルが手の届く範囲にエサを置いた条件を指定することになります(上の図の下の条件)."なし"とした場合は片方のサルにだけ届く位置にエサが置かれました."どちらも"とした場合,エサの置かれた位置を区別しないという意です.<br />
<br />
:*; 時間窓<br />
:条件”エサ見せ”と”エサ置き”を基準とした時間でデータを解析します.時間はすべて500msの幅をもたせています.<br />
# "エサ見せ" と "前": エサ見せの前750msから前249msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "前後": エサ見せの前250msから後249msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "後": エサ見せの後250msから後499msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前": エサ置きの前1000msから前501msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前後": エサ置きの前500msから前1msまでの時間で解析をします.サルの腕の運動が始まる時間帯です.<br />
# "エサ置き" と "後": エサ置きの前後0msから後499msまでの時間で解析をします.<br />
<br />
:*;信号 (周波数成分,バンドパワー)について<br />
:脳波を構成する成分を選択します.時間窓にFFTでパワースペクトルを求めています.<br />
# "デルタ": 2 Hzのパワースペクトル.<br />
# "シータ": 4 Hz から6 Hzのパワースペクトルの和<br />
# "アルファ": 8 Hz から 12 Hzのパワースペクトルの和. <br />
# "ベータ": 14 Hz から 28 Hzのパワースペクトルの和.<br />
# "低ガンマ": 30 Hz から 58 Hzのパワースペクトルの和.ただし電源ノイズがのる 50 Hzを除く.<br />
# "高ガンマ": 60 Hz から100 Hzのパワースペクトルの和..<br />
<br />
:*; 統計検定<br />
:MannWhitney テストをチャンネル毎に行います. 円の位置は電極の位置を示します.<br />
:条件を設定後,「描画」ボタンを押すと条件間で検定をかけ,以下の有意水準で有意差があったとみなせるチャンネルを色づけされます.<br />
# 赤色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.0001).<br />
# 橙色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.001).<br />
# 水色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.001).<br />
# 青色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.0001). <br />
<br />
*; 指南書<br />
:下記のURLからダウンロードできます.<br />
:http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf<br />
<br />
<br />
*スタッフ<br />
** 企画,解析: Naoya Oosugi <br />
** Web アプリ開発: Takaharu Matsuo<br />
** 実験者: Toru Yanagawa<br />
** 総監督: Naotaka Fujii</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins_jp&diff=439Begins jp2011-09-20T06:31:54Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div>[[File:Begins.png]]<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/begins.html<br />
<br />
[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
*; データについて<br />
# ”Day1” のデータは下記のURLにて公開してあります.詳細はそこを参照してください. (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day2" のデータは"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.<br />
# "Sleep" 条件は別の日に行った麻酔実験の麻酔時のデータを用いてます. <br />
:この麻酔実験のデータと詳細は近々アップロードします.<br />
<br />
*;解析について<br />
**;誰が<br />
:自分(ECoGを測定されているサル)と相手のどちらがエサを食べたか条件なのかを指定します.”どちらか”というのは誰が食べたのかを区別しないという意です.<br />
**どの手で<br />
:エサを食べたのを右と左のどちらで行った条件かを指定します."誰が"を相手にした場合は相手がどちらの手でエサを食べたのかを指定することになります.”どちらか”というのはどの手で食べたのかを区別しないという意です<br />
<br />
**; 時間窓<br />
:条件”エサ見せ”と”エサ置き”を基準とした時間でデータを解析します.時間はすべて500msの幅をもたせています.<br />
# "エサ見せ" と "前": エサ見せの前750msから前249msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "前後": エサ見せの前250msから後249msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "後": エサ見せの後250msから後499msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前": エサ置きの前1000msから前501msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前後": エサ置きの前500msから前1msまでの時間で解析をします.サルの腕の運動が始まる時間帯です.<br />
# "エサ置き" と "後": エサ置きの前後0msから後499msまでの時間で解析をします.<br />
<br />
:*;信号 (周波数成分,バンドパワー)について<br />
:脳波を構成する成分を選択します.時間窓にFFTでパワースペクトルを求めています.<br />
# "デルタ": 2 Hzのパワースペクトル.<br />
# "シータ": 4 Hz から6 Hzのパワースペクトルの和<br />
# "アルファ": 8 Hz から 12 Hzのパワースペクトルの和. <br />
# "ベータ": 14 Hz から 28 Hzのパワースペクトルの和.<br />
# "低ガンマ": 30 Hz から 58 Hzのパワースペクトルの和.ただし電源ノイズがのる 50 Hzを除く.<br />
# "高ガンマ": 60 Hz から100 Hzのパワースペクトルの和..<br />
<br />
:*; 統計検定<br />
:MannWhitney テストをチャンネル毎に行います. 円の位置は電極の位置を示します.<br />
:条件を設定後,「描画」ボタンを押すと条件間で検定をかけ,以下の有意水準で有意差があったとみなせるチャンネルを色づけされます.<br />
# 赤色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.0001).<br />
# 橙色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.001).<br />
# 水色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.001).<br />
# 青色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.0001). <br />
<br />
*; 指南書<br />
:下記のURLからダウンロードできます.<br />
:http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf<br />
<br />
<br />
*スタッフ<br />
** 企画,解析: Naoya Oosugi <br />
** Web アプリ開発: Takaharu Matsuo<br />
** 実験者: Toru Yanagawa<br />
** 総監督: Naotaka Fujii</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins_jp&diff=438Begins jp2011-09-20T06:21:47Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div>[[File:Begins.png]]<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/begins.html<br />
<br />
[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
*; データについて<br />
# ”Day1” のデータは下記のURLにて公開してあります.詳細はそこを参照してください. (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day2" のデータは"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.<br />
# "Sleep" 条件は別の日に行った麻酔実験の麻酔時のデータを用いてます. <br />
:この麻酔実験のデータと詳細は近々アップロードします.<br />
<br />
*;解析について<br />
**; 時間窓<br />
:条件”エサ見せ”と”エサ置き”を基準とした時間でデータを解析します.時間はすべて500msの幅をもたせています.<br />
# "エサ見せ" と "前": エサ見せの前750msから前249msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "前後": エサ見せの前250msから後249msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "後": エサ見せの後250msから後499msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前": エサ置きの前1000msから前501msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前後": エサ置きの前500msから前1msまでの時間で解析をします.サルの腕の運動が始まる時間帯です.<br />
# "エサ置き" と "後": エサ置きの前後0msから後499msまでの時間で解析をします.<br />
<br />
:*;信号 (周波数成分,バンドパワー)について<br />
:脳波を構成する成分を選択します.時間窓にFFTでパワースペクトルを求めています.<br />
# "デルタ": 2 Hzのパワースペクトル.<br />
# "シータ": 4 Hz から6 Hzのパワースペクトルの和<br />
# "アルファ": 8 Hz から 12 Hzのパワースペクトルの和. <br />
# "ベータ": 14 Hz から 28 Hzのパワースペクトルの和.<br />
# "低ガンマ": 30 Hz から 58 Hzのパワースペクトルの和.ただし電源ノイズがのる 50 Hzを除く.<br />
# "高ガンマ": 60 Hz から100 Hzのパワースペクトルの和..<br />
<br />
:*; 統計検定<br />
:MannWhitney テストをチャンネル毎に行います. 円の位置は電極の位置を示します.<br />
:条件を設定後,「描画」ボタンを押すと条件間で検定をかけ,以下の有意水準で有意差があったとみなせるチャンネルを色づけされます.<br />
# 赤色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.0001).<br />
# 橙色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.001).<br />
# 水色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.001).<br />
# 青色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.0001). <br />
<br />
*; 指南書<br />
:下記のURLからダウンロードできます.<br />
:http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf<br />
<br />
<br />
*スタッフ<br />
** 企画,解析: Naoya Oosugi <br />
** Web アプリ開発: Takaharu Matsuo<br />
** 実験者: Toru Yanagawa<br />
** 総監督: Naotaka Fujii</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins_jp&diff=437Begins jp2011-09-20T06:21:09Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div>[[File:Begins.png]]<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/begins.html<br />
<br />
[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
*; データについて<br />
# ”Day1” のデータは下記のURLにて公開してあります.詳細はそこを参照してください. (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day2" のデータは"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.<br />
# "Sleep" 条件は別の日に行った麻酔実験の麻酔時のデータを用いてます. <br />
:この麻酔実験のデータと詳細は近々アップロードします.<br />
<br />
*;解析について<br />
**; 時間窓<br />
:条件”エサ見せ”と”エサ置き”を基準とした時間でデータを解析します.時間はすべて500msの幅をもたせています.<br />
# "エサ見せ" と "前": エサ見せの前750msから前249msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "前後": エサ見せの前250msから後249msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "後": エサ見せの後250msから後499msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前": エサ置きの前1000msから前501msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前後": エサ置きの前500msから前1msまでの時間で解析をします.サルの腕の運動が始まる時間帯です.<br />
# "エサ置き" と "後": エサ置きの前後0msから後499msまでの時間で解析をします.<br />
<br />
:*;信号 (周波数成分,バンドパワー)について<br />
:脳波を構成する成分を選択します.時間窓にFFTでパワースペクトルを求めています.<br />
# "デルタ": 2 Hzのパワースペクトル.<br />
# "シータ": 4 Hz から6 Hzのパワースペクトルの和<br />
# "アルファ": 8 Hz から 12 Hzのパワースペクトルの和. <br />
# "ベータ": 14 Hz から 28 Hzのパワースペクトルの和.<br />
# "低ガンマ": 30 Hz から 58 Hzのパワースペクトルの和.ただし電源ノイズがのる 50 Hzを除く.<br />
# "高ガンマ": 60 Hz から100 Hzのパワースペクトルの和..<br />
<br />
:*; 統計検定<br />
:MannWhitney テストをチャンネル毎に行う. 円の位置は電極の位置を示す.<br />
:条件を設定後,「描画」ボタンを押すと条件間で検定をかけ,以下の有意水準で有意差があったとみなせるチャンネルを色づけする.<br />
# 赤色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.0001).<br />
# 橙色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.001).<br />
# 水色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.001).<br />
# 青色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.0001). <br />
<br />
*; 指南書<br />
:下記のURLからダウンロードできます.<br />
:http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf<br />
<br />
<br />
*スタッフ<br />
** 企画,解析: Naoya Oosugi <br />
** Web アプリ開発: Takaharu Matsuo<br />
** 実験者: Toru Yanagawa<br />
** 総監督: Naotaka Fujii</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins_jp&diff=436Begins jp2011-09-20T06:18:46Z<p>Oosugi: Created page with "File:Begins.png http://begins.neurotycho.org/ File:Neurotycho.png *; データについて # ”Day1” のデータは下記のURLにて公開してあります.詳..."</p>
<hr />
<div>[[File:Begins.png]]<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/<br />
<br />
[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
*; データについて<br />
# ”Day1” のデータは下記のURLにて公開してあります.詳細はそこを参照してください. (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day2" のデータは"Day1"と同じ課題を別の日に行ったものです.<br />
# "Sleep" 条件は別の日に行った麻酔実験の麻酔時のデータを用いてます. <br />
:この麻酔実験のデータと詳細は近々アップロードします.<br />
<br />
*;解析について<br />
**; 時間窓<br />
:条件”エサ見せ”と”エサ置き”を基準とした時間でデータを解析します.時間はすべて500msの幅をもたせています.<br />
# "エサ見せ" と "前": エサ見せの前750msから前249msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "前後": エサ見せの前250msから後249msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ見せ" と "後": エサ見せの後250msから後499msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前": エサ置きの前1000msから前501msまでの時間で解析をします.<br />
# "エサ置き" と "前後": エサ置きの前500msから前1msまでの時間で解析をします.サルの腕の運動が始まる時間帯です.<br />
# ""エサ置き" と "後": エサ置きの前後0msから後499msまでの時間で解析をします.<br />
<br />
:*;信号 (周波数成分,バンドパワー)について<br />
:脳波を構成する成分を選択します.時間窓にFFTでパワースペクトルを求めています.<br />
# "デルタ": 2 Hzのパワースペクトル.<br />
# "シータ": 4 Hz から6 Hzのパワースペクトルの和<br />
# "アルファ": 8 Hz から 12 Hzのパワースペクトルの和. <br />
# "ベータ": 14 Hz から 28 Hzのパワースペクトルの和.<br />
# "低ガンマ": 30 Hz から 58 Hzのパワースペクトルの和.ただし電源ノイズがのる 50 Hzを除く.<br />
# "高ガンマ": 60 Hz から100 Hzのパワースペクトルの和..<br />
<br />
:*; 統計検定<br />
:MannWhitney テストをチャンネル毎に行う. 円の位置は電極の位置を示す.<br />
:条件を設定後,「描画」ボタンを押すと条件間で検定をかけ,以下の有意水準で有意差があったとみなせるチャンネルを色づけする.<br />
# 赤色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.0001).<br />
# 橙色: 条件 1 > 条件 2 (p < 0.001).<br />
# 水色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.001).<br />
# 青色: 条件 2 > 条件 1 (p < 0.0001). <br />
<br />
*; 指南書<br />
:下記のURLからダウンロードできます.<br />
:http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf<br />
<br />
<br />
*スタッフ<br />
** 企画,解析: Naoya Oosugi <br />
** Web アプリ開発: Takaharu Matsuo<br />
** 実験者: Toru Yanagawa<br />
** 総監督: Naotaka Fujii</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins&diff=425Begins2011-09-06T07:38:21Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div>[[File:Begins.png]]<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/<br />
<br />
[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
*; Data<br />
# "Day 1" is a dataset already uploaded on Neurotycho (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day 2" is a dataset recorded on the next day of "Day1".<br />
# "Sleep" condition is a dataset in "Sleep task" recorded on separate day. <br />
:Additional data will be uploaded soon.<br />
<br />
*;Analysis<br />
**; Time window<br />
:There are three time windows (size=500ms) prepared for each of two task events, "Show food" and "Food place".<br />
# "Show food" + "Early": window was set between -750 ms and -249 ms around "Show food" event.<br />
# "Show food" + "Middle": window was set between -250 ms and +249 ms around "Show food" event.<br />
# "Show food" + "Late": window was set between +250 ms and +750 ms around "Show food" event.<br />
# "Food place" + "Early": window was set between-1000 ms and -501 ms around "Food place" event.<br />
# "Food place" + "Middle": window was set between -500 ms and -1 ms around "Food place" event. At some point during the window, monkey had already started reaching motion.<br />
# "Food place" + "Late": window was set between 0 ms and + 499 ms around "Food place" event.<br />
<br />
:*; Frequency band power<br />
:Power spectrum of ECoG data at each time window was calculated by FFT.<br />
# "Delta": power spectrum at 2 Hz.<br />
# "Theta": power spectrum summated within 4 Hz and 6 Hz.<br />
# "Alpha": power spectrum summated within 8 Hz and 12 Hz. <br />
# "Beta": power spectrum summated within 14 Hz and 28 Hz.<br />
# "Low Gamma": power spectrum summated within 30 Hz and 58 Hz except 50 Hz.<br />
# "High Gamma": power spectrum summated within 60 Hz and 100 Hz.<br />
<br />
:*; Statistics test<br />
:MannWhitney test will be used for statistical comparison. Circles indicate locations of electrode.<br />
:After setting all parameters and when "Draw" button is pressed, statistical comparison will be made. Results will be shown by color by following rules.<br />
# Red: condition 1 > condition 2 (p < 0.0001).<br />
# Brown: condition 1 > condition 2 (p < 0.001).<br />
# Light blue: condition 2 > condition 1 (p < 0.001).<br />
# Blue: condition 2 > condition 1 (p < 0.0001). <br />
<br />
*; Guide (in Japanese)<br />
:Please download BEGINS Guidebook from a link below.<br />
:http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf<br />
:English guidebook will be released soon.<br />
<br />
*; Credit<br />
** Plan, Program and Analysis: Naoya Oosugi <br />
** Main Program: Takaharu Matsuo<br />
** Experiment: Toru Yanagawa<br />
** General Direction: Naotaka Fujii</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins&diff=413Begins2011-09-05T14:16:12Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div>[[File:Begins.png]]<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/begins.html (日本語版)<br />
<br />
[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
*; Data<br />
# "Day 1" was uploaded on Neurotycho (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day 2" was same experiment as "Day 1" except date of experiment. ( "Day 1" means 2010/08/03, "Day 2" means 2010/08/04.)<br />
# "Sleep" was different experiment as social-competition-task. It was an anesthesia experiment.<br />
These data will be uploaded soon.<br />
<br />
*;Analysis<br />
**; Time window<br />
"Show food" or "Food place" and condition of "When?" decide time window for analysis.<br />
# "Show food" + "Early" means before start time at show food to monkeys (during -750 ms and -249 ms).<br />
# "Show food" + "Middle" means around start time at show food to monkeys (during -250 ms and +249 ms).<br />
# "Show food" + "Late" means after start time of show food to monkeys (during +250 ms and +750 ms).<br />
# "Food place" + "Early" means before time at putting a food on the table during (-1000 ms and -501 ms).<br />
# "Food place" + "Middle" means before time at putting a food on the table during (-500 ms and -1 ms). But the monkey started to move in this time window.<br />
# "Food place" + "Late" means after time at putting a food on the table (during 0 ms and + 499 ms).<br />
<br />
**; Frequency band power<br />
I used FFT to make power spectrum from ECoG data on each time windows.<br />
# "Delta" means a power spectrum (2 Hz).<br />
# "Theta" means power spectrum (summation of between 4 Hz and 6 Hz).<br />
# "Alpha" means power spectrum (summation of during 8 Hz and 12 Hz). <br />
# "Beta" means power spectrum (summation of during 14 Hz and 28 Hz).<br />
# "Low Gamma" means power spectrum (summation of during 30 Hz and 58 Hz without 50 Hz).<br />
# "High Gamma" means power spectrum (summation of during 60 Hz and 100 Hz).<br />
<br />
**; Statistics test<br />
I used MannWhitney test. Location of marks means location of electrodes.<br />
# Red mark means condition 1 > condition 2 (p < 0.0001).<br />
# Orange mark means condition 1 > condition 2 (p < 0.001).<br />
# Light blue mark means condition 2 > condition 1 (p < 0.001).<br />
# Blue mark means condition 2 > condition 1 (p < 0.0001). <br />
<br />
*; Guide (in Japanese)<br />
http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins&diff=412Begins2011-09-05T14:12:45Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div>[[File:Begins.png]]<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/begins.html (日本語版)<br />
<br />
[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
*; Data<br />
# "Day 1" was uploaded on Neurotycho (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# "Day 2" was same experiment as "Day 1" except date of experiment. ( "Day 1" means 2010/08/03, "Day 2" means 2010/08/04.)<br />
# "Sleep" was different experiment as social-competition-task. It was an anesthesia experiment.<br />
These data will be uploaded soon.<br />
<br />
*;Analysis<br />
**; Time window<br />
"Show food" or "Food place" and condition of "When?" decide time window for analysis.<br />
# "Show food" + "Early" means before start time at show food to monkeys (during -750 ms and -249 ms).<br />
# "Show food" + "Middle" means around start time at show food to monkeys (during -250 ms and +249 ms).<br />
# "Show food" + "Late" means after start time of show food to monkeys (during +250 ms and +750 ms).<br />
# "Food place" + "Early" means before time at putting a food on the table during (-1000 ms and -501 ms).<br />
# "Food place" + "Middle" means before time at putting a food on the table during (-500 ms and -1 ms). But the monkey started to move in this time window.<br />
# "Food place" + "Late" means after time at putting a food on the table (during 0 ms and + 499 ms).<br />
<br />
**; Frequency<br />
I used FFT to make power spectrum on each time windows.<br />
# "Delta" means a power spectrum (2 Hz).<br />
# "Theta" means power spectrum (summation of between 4 Hz and 6 Hz).<br />
# "Alpha" means power spectrum (summation of during 8 Hz and 12 Hz). <br />
# "Beta" means power spectrum (summation of during 14 Hz and 28 Hz).<br />
# "Low Gamma" means power spectrum (summation of during 30 Hz and 58 Hz without 50 Hz).<br />
# "High Gamma" means power spectrum (summation of during 60 Hz and 100 Hz).<br />
<br />
**; Statistics test<br />
I used MannWhitney test. Location of marks means location of electrodes.<br />
# Red mark means condition 1 > condition 2 (p < 0.0001).<br />
# Orange mark means condition 1 > condition 2 (p < 0.001).<br />
# Light blue mark means condition 2 > condition 1 (p < 0.001).<br />
# Blue mark means condition 2 > condition 1 (p < 0.0001). <br />
<br />
*; Guide (in Japanese)<br />
http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins&diff=411Begins2011-09-05T13:44:56Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div>[[File:Begins.png]]<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/begins.html (日本語版)<br />
<br />
[[File:Neurotycho.png]]<br />
<br />
*; Data<br />
# 1 Day 1 was uploaded on Neurotycho (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# 2 Day 2 was same experiment as Day 1 except "day". ( Day 1 means 2010/08/03, Day 2 means 2010/08/04)<br />
# 1 Sleep was different experiment as social-competition-task. It was anesthesia experiment.<br />
<br />
*;Analysis<br />
**; Time window<br />
# 3 Show food + 1 Early means during start time of show food to monkeys -750 ms and -249 ms.<br />
# 3 Show food + 2 Middle means during start time of show food to monkeys -250 ms and +249 ms.<br />
# 3 Show food + 3 Late means during start time of show food to monkeys +250 ms and +750 ms.<br />
# 4 Food place + 1 Early means during time at putting a food on the table -1000 ms and -501 ms.<br />
# 4 Food place + 2 Middle means during time at putting a food on the table -500 ms and -1 ms.<br />
# 4 Food place + 1 Early means during time at putting a food on the table 0 ms and + 499 ms.<br />
<br />
**; Frequency<br />
I used FFT to make power spectrum on each time windows.<br />
# 1 Delta means a power spectrum (2 Hz).<br />
# 2 Theta means power spectrum (summation of between 4 Hz and 6 Hz).<br />
# 3 Alpha means power spectrum (summation of during 8 Hz and 12 Hz). <br />
# 4 Beta means power spectrum (summation of during 14 Hz and 28 Hz).<br />
# 5 Low Gamma means power spectrum (summation of during 30 Hz and 58 Hz without 50 Hz).<br />
# 6 High Gamma means power spectrum (summation of during 60 Hz and 100 Hz).<br />
<br />
**; Statistics test<br />
I used MannWhitney test. Location of marks means location of electrodes.<br />
# Red mark means condition 1 > condition 2 (p < 0.0001).<br />
# Orange mark means condition 1 > condition 2 (p < 0.001).<br />
# Light blue mark means condition 2 > condition 1 (p < 0.001).<br />
# Blue mark means condition 2 > condition 1 (p < 0.0001). <br />
<br />
*; Guide (in Japanese)<br />
http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=File:Neurotycho.png&diff=410File:Neurotycho.png2011-09-05T13:43:50Z<p>Oosugi: Showing sequence of social conflict task</p>
<hr />
<div>Showing sequence of social conflict task</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins&diff=408Begins2011-09-05T07:14:33Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div>[[File:Begins.png]]<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/begins.html (日本語版)<br />
*; Data<br />
# 1 Day 1 was uploaded on Neurotycho (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# 2 Day 2 was same experiment as Day 1 except "day". ( Day 1 means 2010/08/03, Day 2 means 2010/08/04)<br />
# 1 Sleep was different experiment as social-competition-task. It was anesthesia experiment.<br />
<br />
*;Analysis<br />
**; Time window<br />
# 3 Show food + 1 Early means during start time of show food to monkeys -750 ms and -249 ms.<br />
# 3 Show food + 2 Middle means during start time of show food to monkeys -250 ms and +249 ms.<br />
# 3 Show food + 3 Late means during start time of show food to monkeys +250 ms and +750 ms.<br />
# 4 Food place + 1 Early means during time at putting a food on the table -1000 ms and -501 ms.<br />
# 4 Food place + 2 Middle means during time at putting a food on the table -500 ms and -1 ms.<br />
# 4 Food place + 1 Early means during time at putting a food on the table 0 ms and + 499 ms.<br />
<br />
**; Frequency<br />
I used FFT to make power spectrum on each time windows.<br />
# 1 Delta means a power spectrum (2 Hz).<br />
# 2 Theta means power spectrum (summation of between 4 Hz and 6 Hz).<br />
# 3 Alpha means power spectrum (summation of during 8 Hz and 12 Hz). <br />
# 4 Beta means power spectrum (summation of during 14 Hz and 28 Hz).<br />
# 5 Low Gamma means power spectrum (summation of during 30 Hz and 58 Hz without 50 Hz).<br />
# 6 High Gamma means power spectrum (summation of during 60 Hz and 100 Hz).<br />
<br />
**; Statistics test<br />
I used MannWhitney test. <br />
# Red mark means condition 1 > condition 2 ( p < 0.0001) in signals of this channel.<br />
# Orange mark means condition 1 > condition 2 (p<0.001).<br />
# Light blue means condition 2 > condition 1 (p<0.001).<br />
# Blue means condition 2 > condition 1 (p<0.0001). <br />
<br />
*; Guide (in Japanese)<br />
http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins&diff=407Begins2011-09-05T07:13:46Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div>[[File:Begins.png]]<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/begins.html (日本語版)<br />
*; Data<br />
# 1 Day 1 was uploaded on Neurotycho (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# 2 Day 2 was same experiment as Day 1 except "day". ( Day 1 means 2010/08/03, Day 2 means 2010/08/04)<br />
# 1 Sleep was different experiment as social-competition-task. It was anesthesia experiment.<br />
<br />
*;Analysis<br />
**; Time window<br />
# 3 Show food + 1 Early means during start time of show food to monkeys -750 ms and -249 ms.<br />
# 3 Show food + 2 Middle means during start time of show food to monkeys -250 ms and +249 ms.<br />
# 3 Show food + 3 Late means during start time of show food to monkeys +250 ms and +750 ms.<br />
# 4 Food place + 1 Early means during time at putting a food on the table -1000 ms and -501 ms.<br />
# 4 Food place + 2 Middle means during time at putting a food on the table -500 ms and -1 ms.<br />
# 4 Food place + 1 Early means during time at putting a food on the table 0 ms and + 499 ms.<br />
<br />
**; Frequency<br />
I used FFT to make power spectrum on each time windows.<br />
# 1 Delta means a power spectrum (2 Hz).<br />
# 2 Theta means power spectrum (summation of between 4 Hz and 6 Hz).<br />
# 3 Alpha means power spectrum (summation of during 8 Hz and 12 Hz). <br />
# 4 Beta means power spectrum (summation of during 14 Hz and 28 Hz).<br />
# 5 Low Gamma means power spectrum (summation of during 30 Hz and 58 Hz without 50 Hz).<br />
# 6 High Gamma means power spectrum (summation of during 60 Hz and 100 Hz).<br />
<br />
**; Statistics test<br />
I used MannWhitney test. Red mark means condition 1 > condition 2 ( p < 0.0001) in signals of this channel. Orange mark means condition 1 > condition 2 (p<0.001). Light blue means condition 2 > condition 1 (p<0.001). Blue means condition 2 > condition 1 (p<0.0001). <br />
<br />
*; Guide (in Japanese)<br />
http://begins.neurotycho.org/guide_jp.pdf</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Main_Page&diff=406Main Page2011-09-05T07:07:03Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div>'''Wiki for Neurotycho.org'''<br />
<br />
Welcome to Wiki.Neurotycho!<br />
<br />
Project Tycho is named after Tycho Brahe. The project aims to share reliable massive neural and behavioral data for understanding brain mechanism. The dataset was recorded and distributed by Laboratory for Adaptive Intelligence, BSI, RIKEN. It is not only for neuroscientists but for everyone who is interested in learning neural mechanism.<br />
<br />
[[File:Ss.png]]<br />
<br />
<br />
CC0<br />
<br />
<br />
== Menu ==<br />
*Manual<br />
** [[Manual|Install Manual for Python and others]]<br />
** [[Manual_jp|Install manual for Python and others in Japanese]]<br />
<br><br />
*Web application<br />
**[[Begins]]<br />
<br />
*Methods<br />
**[[Multi-dimensional Recording]]<br />
***[[ECoG]]<br />
***[[Motion Capture]]<br />
***[[Non-invasive Head Fixture]]<br />
***[[Head Free Eye Tracking]]<br />
***[[Surgical Procedure]]<br />
<br><br />
*Preliminary results<br />
**[[EEG-ECoG recording]]<br />
<br><br />
*FAQ for each Task<br />
**[[Visual Grating Task]]<br />
**[[Sleep Task]]<br />
**[[Social Competition Task]]<br />
**[[Emotional Movie Task]]<br />
**[[Food-Tracking Task]]<br />
**[[Spatial Map of ECoG array]]<br />
<br><br />
*Open Lab @ RIKEN BSI<br />
**[[Open Lab|What is Open Lab?]]<br />
<br />
<br />
----<br />
<br />
To the extent possible under law, neurotycho.org has waived all copyright and related or neighboring rights to downloadable dataset in Project Tycho. This work is published from: Japan.</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=Begins&diff=404Begins2011-09-05T04:27:23Z<p>Oosugi: Created page with "File:Begins.png http://begins.neurotycho.org/ http://begins.neurotycho.org/begins.html (日本語版) *; Data # 1 Day 1 was uploaded on Neurotycho (http://neurotycho.org/so..."</p>
<hr />
<div>[[File:Begins.png]]<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/<br />
<br />
http://begins.neurotycho.org/begins.html (日本語版)<br />
*; Data<br />
# 1 Day 1 was uploaded on Neurotycho (http://neurotycho.org/social-competition-task).<br />
# 2 Day 2 was same experiment as Day 1 except "day". ( Day 1 means 2010/08/03, Day 2 means 2010/08/04)<br />
# 1 Sleep was different experiment as social-competition-task. It was anesthesia experiment.<br />
<br />
*;Analysis<br />
**; Time window<br />
# 3 Show food + 1 Early means during start time of show food to monkeys -750 ms and -249 ms.<br />
# 3 Show food + 2 Middle means during start time of show food to monkeys -250 ms and +249 ms.<br />
# 3 Show food + 3 Late means during start time of show food to monkeys +250 ms and +750 ms.<br />
# 4 Food place + 1 Early means during time at putting a food on the table -1000 ms and -501 ms.<br />
# 4 Food place + 2 Middle means during time at putting a food on the table -500 ms and -1 ms.<br />
# 4 Food place + 1 Early means during time at putting a food on the table 0 ms and + 499 ms.<br />
**; Frequency<br />
I used FFT to make power spectrum on each time windows.<br />
# 1 Delta means a power spectrum (2 Hz).<br />
# 2 Theta means power spectrum (summation of between 4 Hz and 6 Hz).<br />
# 3 Alpha means power spectrum (summation of during 8 Hz and 12 Hz). <br />
# 4 Beta means power spectrum (summation of during 14 Hz and 28 Hz).<br />
# 5 Low Gamma means power spectrum (summation of during 30 Hz and 58 Hz without 50 Hz).<br />
# 6 High Gamma means power spectrum (summation of during 60 Hz and 100 Hz).</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=File:Begins.png&diff=403File:Begins.png2011-09-05T03:57:57Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div></div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=EEG-ECoG_recording&diff=269EEG-ECoG recording2011-06-27T03:45:01Z<p>Oosugi: /* Oosugi Naoya */</p>
<hr />
<div>== '''20110607S2_EEGandECoG_Su_Oosugi+Naoya-Nagasaka+Yasuo-Hasegawa+Naomi_mat_ECoG128-EEG18''' ==<br />
<br />
== Oosugi Naoya ==<br />
*;Data<br />
*:ECoG05_anesthesia.mat and EEG05_anesthesia.mat<br />
*;Processing<br />
*:The data were processed in Matlab.<br />
**;Band-pass filter<br />
**:4th order butter worth filter(Signal Processing Toolbox)<br />
**;Regression<br />
**:PCA+Linear regression(Statistics Toolbox)<br><br />
**::PCA was used as whitening.<br />
**;Model Estimation<br />
**:4-fold cross validation test<br />
**::It did NOT destroy the structure of time-series.<br />
**;Prediction rate<br />
**:Correlation coefficient between test data and predicted data<br />
*;Result<br />
[[File:EEG_head_map_1_45.png|500px]]<br />
*;1. Plotted EEG prediction rate via ECoG on head map<br />
*:EEGs and ECoGs were bandpass-filtered between 1 and 45 Hz. Color bar means prediction rate. Black points means locations of EEG channels(without Cz) but these are not correct because this subject is monkey! This figure shows that all EEG channels can be predicted via ECoG and prediction rate of left EEGs is better than right.<br />
[[File:bp_all.png|500px]]<br />
*;2. Compared EEG prediction rate via ECoG during time-frequency bands<br />
*:EEGs and ECoGs were bandpass-filtered in the time-frequency bands of Theta(between 4 and 7Hz), Alpha(between 8 and 13Hz), low Beta(between 14 and 20Hz), high Beta(between 21 and 30Hz) and Gamma(between 31 and 45Hz). x-axis means time-frequency bands and y-axis means locations of EEG channels. Color bar means prediction rate. This figure shows high frequency components of EEGs are harder to be predicted via ECoGs.<br />
[[File:Theta.png|500px]]<br />
*;3. Prediction rate of EEGs in the frequency band of Theta via ECoGs in the frequency band of Theta or not<br />
*:EEGs in the frequency band of Theta were predicted via ECoGs in the frequency band of Theta and ECoGs without the frequency band of Theta(bandcut-filtered between 4 and 7Hz). x-axis means locations of EEG channels and y-axis means prediction rate. Blue bar means prediction rate of Thete EEGs via Theta ECoGs and red bar means prediction rate of Theta EEGs via EEGs without Theta components. This figure shows the time-frequency band of EEG and ECoG is very similar.<br />
[[File:T8_1_45.png|500px]]<br />
*;4.ECoG prediction rate via EEG in the time-frequency between 1 and 45Hz<br />
*:EEGs and ECoGs were bandpass-filtered between 1 and 45 Hz. Color points means locations of ECoG electrodes and [R = prediction rate * 255, G = 0, B = 0](If prediction rate < 0 then R = 0). This figure shows EEGs include informations of low frequency components of ECoG.<br />
[[File:T8_60_100.png|500px]]<br />
*;5.ECoG prediction rate via EEG in the time-frequency between 60 and 100Hz<br />
*:EEGs and ECoGs were bandpass-filtered between 60 and 100 Hz. Color points means locations of ECoG electrodes and [R = prediction rate * 255, G = 0, B = 0](If prediction rate < 0 then R = 0). This figure shows EEGs do NOT include informations of high frequency components of ECoG.</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=EEG-ECoG_recording&diff=268EEG-ECoG recording2011-06-27T03:42:11Z<p>Oosugi: /* Oosugi Naoya */</p>
<hr />
<div>== '''20110607S2_EEGandECoG_Su_Oosugi+Naoya-Nagasaka+Yasuo-Hasegawa+Naomi_mat_ECoG128-EEG18''' ==<br />
<br />
== Oosugi Naoya ==<br />
*;Data<br />
*:ECoG05_anesthesia.mat and EEG05_anesthesia.mat<br />
*;Processing<br />
*:The data were processed in MatLab.<br />
**;Band-pass filter<br />
**:4th order butter worth filter(Signal Processing Toolbox)<br />
**;Regression<br />
**:PCA+Linear regression(Statistics Toolbox)<br><br />
**::PCA was used as whitening.<br />
**;Model Estimation<br />
**:4-fold cross validation test<br />
**::It did NOT destroy the structure of time-series.<br />
**;Prediction rate<br />
**:Correlation coefficient between test data and predicted data<br />
*;Result<br />
[[File:EEG_head_map_1_45.png|500px]]<br />
*;1. Plotted EEG prediction rate via ECoG on head map<br />
*:EEGs and ECoGs were bandpass-filtered between 1 and 45 Hz. Color bar means prediction rate. Black points means locations of EEG channels(without Cz) but these are not correct because this subject is monkey! This figure shows that all EEG channels can be predicted via ECoG and prediction rate of left EEGs is better than right.<br />
[[File:bp_all.png|500px]]<br />
*;2. Compared EEG prediction rate via ECoG during time-frequency bands<br />
*:EEGs and ECoGs were bandpass-filtered in the time-frequency bands of Theta(between 4 and 7Hz), Alpha(between 8 and 13Hz), low Beta(between 14 and 20Hz), high Beta(between 21 and 30Hz) and Gamma(between 31 and 45Hz). x-axis means time-frequency bands and y-axis means locations of EEG channels. Color bar means prediction rate. This figure shows high frequency components of EEGs are harder to be predicted via ECoGs.<br />
[[File:Theta.png|500px]]<br />
*;3. Prediction rate of EEGs in the frequency band of Theta via ECoGs in the frequency band of Theta or not<br />
*:EEGs in the frequency band of Theta were predicted via ECoGs in the frequency band of Theta and ECoGs without the frequency band of Theta(bandcut-filtered between 4 and 7Hz). x-axis means locations of EEG channels and y-axis means prediction rate. Blue bar means prediction rate of Thete EEGs via Theta ECoGs and red bar means prediction rate of Theta EEGs via EEGs without Theta components. This figure shows the time-frequency band of EEG and ECoG is very similar.<br />
[[File:T8_1_45.png|500px]]<br />
*;4.ECoG prediction rate via EEG in the time-frequency between 1 and 45Hz<br />
*:EEGs and ECoGs were bandpass-filtered between 1 and 45 Hz. Color points means locations of ECoG electrodes and [R = prediction rate * 255, G = 0, B = 0](If prediction rate < 0 then R = 0). This figure shows EEGs include informations of low frequency components of ECoG.<br />
[[File:T8_60_100.png|500px]]<br />
*;5.ECoG prediction rate via EEG in the time-frequency between 60 and 100Hz<br />
*:EEGs and ECoGs were bandpass-filtered between 60 and 100 Hz. Color points means locations of ECoG electrodes and [R = prediction rate * 255, G = 0, B = 0](If prediction rate < 0 then R = 0). This figure shows EEGs do NOT include informations of high frequency components of ECoG.</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=EEG-ECoG_recording&diff=267EEG-ECoG recording2011-06-27T03:39:29Z<p>Oosugi: /* *20110607S2_EEGandECoG_Su_Oosugi+Naoya-Nagasaka+Yasuo-Hasegawa+Naomi_mat_ECoG128-EEG18 */</p>
<hr />
<div>== '''20110607S2_EEGandECoG_Su_Oosugi+Naoya-Nagasaka+Yasuo-Hasegawa+Naomi_mat_ECoG128-EEG18''' ==<br />
<br />
== Oosugi Naoya ==<br />
*;Data<br />
*:ECoG05_anesthesia.mat and EEG05_anesthesia.mat<br />
*;Processing<br />
*:The data were processed in MatLab.<br />
**;Band-pass filter<br />
**:4th order butter worth filter(Signal Processing Toolbox)<br />
**;Regression<br />
**:PCA+Linear regression(Statistics Toolbox)<br><br />
**::PCA was used as whitening.<br />
**;Model Estimation<br />
**:4-fold cross validation test<br />
**::It did NOT destroy the structure of time-series.<br />
**;Prediction rate<br />
**:Correlation coefficient between test data and predicted data<br />
*;Result<br />
[[File:EEG_head_map_1_45.png|500px]]<br />
*;1. Plotted EEG prediction rate via ECoG on head map<br />
*:EEGs and ECoGs were bandpass-filtered between 1 and 45 Hz. Color bar means prediction rate. Black points means locations of EEG channels(without Cz) but these are not correct because this subject is monkey! This figure shows that all EEG channels can be predicted via ECoG and prediction rate of left EEGs is better than right.<br />
[[File:bp_all.png|500px]]<br />
*;2. Compared EEG prediction rate via ECoG during time-frequency bands<br />
*:EEGs and ECoGs were bandpass-filtered in the time-frequency bands of Theta(between 4 and 7Hz), Alpha(between 8 and 13Hz), low Beta(between 14 and 20Hz), high Beta(between 21 and 30Hz) and Gamma(between 31 and 45Hz). x-axis means time-frequency bands and y-axis means locations of EEG channels. Color bar means prediction rate. This figure shows high frequency components of EEGs are harder to be predicted via ECoGs.<br />
[[File:Theta.png|500px]]<br />
*;3. Prediction rate of EEGs in the frequency band of Theta via ECoGs in the frequency band of Theta or not<br />
*:EEGs in the frequency band of Theta were predicted via ECoGs in the frequency band of Theta and ECoGs without the frequency band of Theta(bandcut-filtered between 4 and 7Hz). x-axis means locations of EEG channels and y-axis means prediction rate. Blue bar means prediction rate of Thete EEGs via Theta ECoGs and red bar means prediction rate of Theta EEGs via EEGs without Theta components. This figure shows the time-frequency band of EEG and ECoG is very similar.<br />
[[File:T8_1_45.png|500px]]<br />
*;4.ECoG prediction rate via EEG in the time-frequency between 1 and 45Hz<br />
*:EEGs and ECoGs were bandpass-filtered between 1 and 45 Hz. Color points means locations of ECoG electrodes and [R = prediction rate * 255, G = 0, B = 0](If prediction rate < 0 then R = 0). This figure shows EEGs include informations of low frequency ECoG.<br />
[[File:T8_60_100.png|500px]]<br />
*;4.ECoG prediction rate via EEG in the time-frequency between 60 and 100Hz<br />
*:EEGs and ECoGs were bandpass-filtered between 60 and 100 Hz. Color points means locations of ECoG electrodes and [R = prediction rate * 255, G = 0, B = 0](If prediction rate < 0 then R = 0). This figure shows EEGs do NOT include informations of high frequency ECoG.</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=EEG-ECoG_recording&diff=266EEG-ECoG recording2011-06-27T03:39:16Z<p>Oosugi: /* Oosugi Naoya */</p>
<hr />
<div>== *'''20110607S2_EEGandECoG_Su_Oosugi+Naoya-Nagasaka+Yasuo-Hasegawa+Naomi_mat_ECoG128-EEG18''' ==<br />
<br />
== Oosugi Naoya ==<br />
*;Data<br />
*:ECoG05_anesthesia.mat and EEG05_anesthesia.mat<br />
*;Processing<br />
*:The data were processed in MatLab.<br />
**;Band-pass filter<br />
**:4th order butter worth filter(Signal Processing Toolbox)<br />
**;Regression<br />
**:PCA+Linear regression(Statistics Toolbox)<br><br />
**::PCA was used as whitening.<br />
**;Model Estimation<br />
**:4-fold cross validation test<br />
**::It did NOT destroy the structure of time-series.<br />
**;Prediction rate<br />
**:Correlation coefficient between test data and predicted data<br />
*;Result<br />
[[File:EEG_head_map_1_45.png|500px]]<br />
*;1. Plotted EEG prediction rate via ECoG on head map<br />
*:EEGs and ECoGs were bandpass-filtered between 1 and 45 Hz. Color bar means prediction rate. Black points means locations of EEG channels(without Cz) but these are not correct because this subject is monkey! This figure shows that all EEG channels can be predicted via ECoG and prediction rate of left EEGs is better than right.<br />
[[File:bp_all.png|500px]]<br />
*;2. Compared EEG prediction rate via ECoG during time-frequency bands<br />
*:EEGs and ECoGs were bandpass-filtered in the time-frequency bands of Theta(between 4 and 7Hz), Alpha(between 8 and 13Hz), low Beta(between 14 and 20Hz), high Beta(between 21 and 30Hz) and Gamma(between 31 and 45Hz). x-axis means time-frequency bands and y-axis means locations of EEG channels. Color bar means prediction rate. This figure shows high frequency components of EEGs are harder to be predicted via ECoGs.<br />
[[File:Theta.png|500px]]<br />
*;3. Prediction rate of EEGs in the frequency band of Theta via ECoGs in the frequency band of Theta or not<br />
*:EEGs in the frequency band of Theta were predicted via ECoGs in the frequency band of Theta and ECoGs without the frequency band of Theta(bandcut-filtered between 4 and 7Hz). x-axis means locations of EEG channels and y-axis means prediction rate. Blue bar means prediction rate of Thete EEGs via Theta ECoGs and red bar means prediction rate of Theta EEGs via EEGs without Theta components. This figure shows the time-frequency band of EEG and ECoG is very similar.<br />
[[File:T8_1_45.png|500px]]<br />
*;4.ECoG prediction rate via EEG in the time-frequency between 1 and 45Hz<br />
*:EEGs and ECoGs were bandpass-filtered between 1 and 45 Hz. Color points means locations of ECoG electrodes and [R = prediction rate * 255, G = 0, B = 0](If prediction rate < 0 then R = 0). This figure shows EEGs include informations of low frequency ECoG.<br />
[[File:T8_60_100.png|500px]]<br />
*;4.ECoG prediction rate via EEG in the time-frequency between 60 and 100Hz<br />
*:EEGs and ECoGs were bandpass-filtered between 60 and 100 Hz. Color points means locations of ECoG electrodes and [R = prediction rate * 255, G = 0, B = 0](If prediction rate < 0 then R = 0). This figure shows EEGs do NOT include informations of high frequency ECoG.</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=File:T8_60_100.png&diff=265File:T8 60 100.png2011-06-27T03:38:02Z<p>Oosugi: ECoG prediction rate via EEG in the time-frequency between 60 and 100Hz</p>
<hr />
<div>ECoG prediction rate via EEG in the time-frequency between 60 and 100Hz</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=File:T8_1_45.png&diff=264File:T8 1 45.png2011-06-27T03:30:15Z<p>Oosugi: ECoG prediction rate via EEG in the time-frequency between 1 and 45Hz</p>
<hr />
<div>ECoG prediction rate via EEG in the time-frequency between 1 and 45Hz</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=EEG-ECoG_recording&diff=263EEG-ECoG recording2011-06-27T03:23:41Z<p>Oosugi: /* Oosugi Naoya */</p>
<hr />
<div>== *'''20110607S2_EEGandECoG_Su_Oosugi+Naoya-Nagasaka+Yasuo-Hasegawa+Naomi_mat_ECoG128-EEG18''' ==<br />
<br />
== Oosugi Naoya ==<br />
*;Processing<br />
*:The data were processed in MatLab.<br />
**;Band-pass filter<br />
**:4th order butter worth filter(Signal Processing Toolbox)<br />
**;Regression<br />
**:PCA+Linear regression(Statistics Toolbox)<br><br />
**::PCA was used as whitening.<br />
**;Model Estimation<br />
**:4-fold cross validation test<br />
**::It did NOT destroy the structure of time-series.<br />
**;Prediction rate<br />
**:Correlation coefficient between test data and predicted data<br />
*;Result<br />
[[File:EEG_head_map_1_45.png]]<br />
*;1. Plotted EEG prediction rate via ECoG on head map<br />
*:EEGs and ECoGs were bandpass-filtered between 1 and 45 Hz. Color bar means prediction rate. Black points means locations of EEG channels(without Cz) but these are not correct because this subject is monkey! This figure shows that all EEG channels can be predicted via ECoG and prediction rate of left EEGs is better than right.<br />
[[File:bp_all.png]]<br />
*;2. Compared EEG prediction rate via ECoG during time-frequency bands<br />
*:EEGs and ECoGs were bandpass-filtered in the time-frequency bands of Theta(between 4 and 7Hz), Alpha(between 8 and 13Hz), low Beta(between 14 and 20Hz), high Beta(between 21 and 30Hz) and Gamma(between 31 and 45Hz). x-axis means time-frequency bands and y-axis means locations of EEG channels. Color bar means prediction rate. This figure shows high frequency components of EEGs are harder to be predicted via ECoGs.<br />
[[File:Theta.png]]<br />
*;3. Prediction rate of EEGs in the frequency band of Theta via ECoGs in the frequency band of Theta or not<br />
*:EEGs in the frequency band of Theta were predicted via ECoGs in the frequency band of Theta and ECoGs without the frequency band of Theta(bandcut-filtered between 4 and 7Hz). x-axis means locations of EEG channels and y-axis means prediction rate. Blue bar means prediction rate of Thete EEGs via Theta ECoGs and red bar means prediction rate of Theta EEGs via EEGs without Theta components. This figure shows the time-frequency band of EEG and ECoG is very similar.</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=EEG-ECoG_recording&diff=262EEG-ECoG recording2011-06-27T03:11:19Z<p>Oosugi: </p>
<hr />
<div>== *'''20110607S2_EEGandECoG_Su_Oosugi+Naoya-Nagasaka+Yasuo-Hasegawa+Naomi_mat_ECoG128-EEG18''' ==<br />
<br />
== Oosugi Naoya ==<br />
*;Processing<br />
*:The data were processed in MatLab.<br />
**;Band-pass filter<br />
**:4th order butter worth filter(Signal Processing Toolbox)<br />
**;Regression<br />
**:PCA+Linear regression(Statistics Toolbox)<br><br />
**::PCA was used as whitening.<br />
**;Model Estimation<br />
**:4-fold cross validation test<br />
**::It did NOT destroy the structure of time-series.<br />
**;Prediction rate<br />
**:Correlation coefficient between test data and predicted data<br />
*;Result<br />
[[File:EEG_head_map_1_45.png]]<br />
*;1. Plotted EEG prediction rate via ECoG on head map<br />
*:EEGs and ECoGs were bandpass-filtered between 1 and 45 Hz. Color bar means prediction rate. Black points means locations of EEG channels(without Cz) but these are not correct because this subject is monkey! This figure shows that all EEG channels can be predicted via ECoG and prediction rate of left EEGs is better than right.<br />
[[File:bp_all.png]]<br />
*;2. Compared EEG prediction rate via ECoG during time-frequency bands<br />
*:EEGs and ECoGs were bandpass-filtered in the time-frequency bands of Theta(between 4 and 7Hz), Alpha(between 8 and 13Hz), low Beta(between 14 and 20Hz), high Beta(between 21 and 30Hz) and Gamma(between 31 and 45Hz). x-axis means time-frequency bands and y-axis means locations of EEG channels. Color bar means prediction rate. This figure shows high frequency components of EEGs are harder to be predicted via ECoGs.</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=File:Theta.png&diff=261File:Theta.png2011-06-27T03:10:54Z<p>Oosugi: EEGs Prediction rate via ECoG in the frequency band of Theta</p>
<hr />
<div>EEGs Prediction rate via ECoG in the frequency band of Theta</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=File:EEG_head_map_1_45.png&diff=260File:EEG head map 1 45.png2011-06-27T02:10:29Z<p>Oosugi: Plotted EEG prediction rate via ECoG on head map</p>
<hr />
<div>Plotted EEG prediction rate via ECoG on head map</div>Oosugihttp://wiki.neurotycho.org/index.php?title=File:Bp_all.png&diff=259File:Bp all.png2011-06-27T01:42:28Z<p>Oosugi: Compared EEG prediction rate via ECoG during time-frequency bands</p>
<hr />
<div>Compared EEG prediction rate via ECoG during time-frequency bands</div>Oosugi